Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC26A0AVF1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC26A0AVF1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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