Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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TCRBV7S3A2A0A539 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV7S3A2A0A539 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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TCRBV7S3A2A0A539 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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