Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.687e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 218.07■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 45.1
DDX52Q9Y2R4 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.359e-8■■■■■ 45
DDX52Q9Y2R4 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.429e-8■■■■■ 45
DDX52Q9Y2R4 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.429e-8■■■■■ 45
DDX52Q9Y2R4 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.59e-8■■■■■ 45
DDX52Q9Y2R4 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.26■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.58□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 44.9
DDX52Q9Y2R4 MLF1-215ENST00000498592 707 ntTSL 322.69■■□□□ 1.228e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.738e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-212ENST00000491767 787 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.688e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.538e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.388e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.378e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.528e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 59.67□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-214ENST00000497004 3048 ntTSL 1 (best)9.65□□□□□ -0.868e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-213ENST00000495452 742 ntTSL 39.26□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-207ENST00000477042 750 ntTSL 57.44□□□□□ -1.228e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.298e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-204ENST00000466246 653 ntTSL 23.92□□□□□ -1.788e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 MLF1-211ENST00000487838 473 ntTSL 23.74□□□□□ -1.818e-8■■■■■ 44.8
DDX52Q9Y2R4 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 520.47■□□□□ 0.875e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.675e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.615e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.515e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 217.84■□□□□ 0.455e-11■■■■■ 44.6
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 44.4
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 44.4
DDX52Q9Y2R4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.472e-6■■■■■ 42.9
DDX52Q9Y2R4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.322e-6■■■■■ 42.9
DDX52Q9Y2R4 EMC10-207ENST00000599293 1926 ntTSL 329.06■■■□□ 2.242e-6■■■■■ 42.9
DDX52Q9Y2R4 EMC10-208ENST00000601780 2178 ntTSL 1 (best)27.73■■■□□ 2.032e-6■■■■■ 42.9
DDX52Q9Y2R4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.782e-6■■■■■ 42.8
DDX52Q9Y2R4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 42.8
DDX52Q9Y2R4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 42.8
DDX52Q9Y2R4 ERF-203ENST00000593944 555 ntTSL 422.14■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 42.8
DDX52Q9Y2R4 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 318.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 42.8
DDX52Q9Y2R4 ERF-205ENST00000595941 227 ntTSL 49.46□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 42.8
DDX52Q9Y2R4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.654e-7■■■■■ 42.6
DDX52Q9Y2R4 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 42.6
DDX52Q9Y2R4 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC13.28□□□□□ -0.288e-9■■■■■ 41.9
DDX52Q9Y2R4 C22orf24-202ENST00000486651 823 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 41.8
DDX52Q9Y2R4 C22orf24-203ENST00000623735 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 41.8
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-206ENST00000502962 1411 ntTSL 519.59■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-215ENST00000510848 554 ntTSL 419.56■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-207ENST00000504739 555 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-210ENST00000506246 572 ntTSL 518.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-212ENST00000508949 552 ntTSL 417.51■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-214ENST00000509695 467 ntTSL 417.27■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 ELF4-203ENST00000434609 406 ntTSL 316.85■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 PFKP-205ENST00000413079 496 ntTSL 316.53■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-208ENST00000505543 687 ntTSL 415.83■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 LGR6-206ENST00000487787 3377 ntTSL 214.27□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 513.26□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 41.7
DDX52Q9Y2R4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.274e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.224e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 325.53■■□□□ 1.684e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 323.64■■□□□ 1.374e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 322.17■■□□□ 1.144e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 422.07■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 522.03■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 321.79■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 318.89■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 318.08■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 513.99□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 41
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