Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK7

RABL2A, Rab-like protein 2A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL2AQ9UBK7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABL2AQ9UBK7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABL2AQ9UBK7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABL2AQ9UBK7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABL2AQ9UBK7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABL2AQ9UBK7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RABL2AQ9UBK7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABL2AQ9UBK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABL2AQ9UBK7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABL2AQ9UBK7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABL2AQ9UBK7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABL2AQ9UBK7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABL2AQ9UBK7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms