Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NMRK1Q9NWW6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NMRK1Q9NWW6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NMRK1Q9NWW6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NMRK1Q9NWW6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NMRK1Q9NWW6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NMRK1Q9NWW6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NMRK1Q9NWW6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NMRK1Q9NWW6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NMRK1Q9NWW6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NMRK1Q9NWW6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NMRK1Q9NWW6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NMRK1Q9NWW6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NMRK1Q9NWW6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NMRK1Q9NWW6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NMRK1Q9NWW6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NMRK1Q9NWW6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NMRK1Q9NWW6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMRK1Q9NWW6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMRK1Q9NWW6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms