Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-219ENST00000545091 1079 ntTSL 518.27■□□□□ 0.523e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.496e-49■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.483e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PSPH-204ENST00000416592 739 ntTSL 517.29■□□□□ 0.363e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.253e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PSPH-206ENST00000421312 633 ntTSL 516.07■□□□□ 0.163e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-215ENST00000540792 951 ntTSL 215.51■□□□□ 0.073e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 DDX54-210ENST00000552375 780 ntTSL 515□□□□□ -0.013e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PSPH-203ENST00000413218 539 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PSPH-205ENST00000419984 744 ntTSL 314.78□□□□□ -0.043e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.056e-49■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PSPH-210ENST00000437355 1409 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PSPH-208ENST00000424596 555 ntTSL 414.36□□□□□ -0.113e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-216ENST00000541725 560 ntTSL 514.23□□□□□ -0.133e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 213.36□□□□□ -0.273e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.313e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 312.19□□□□□ -0.463e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 KDM4D-202ENST00000536741 2737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 AC011603.2-204ENST00000547712 418 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 KDM4D-201ENST00000335080 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.673e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 SRFBP1-202ENST00000504881 567 ntTSL 38.59□□□□□ -1.033e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.113e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 AC011603.2-205ENST00000551496 319 ntTSL 36.58□□□□□ -1.363e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 LZIC-205ENST00000488540 652 ntTSL 26.57□□□□□ -1.363e-37■■■■■ 894.3
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-212ENST00000489099 1285 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.547e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-210ENST00000478138 504 ntTSL 313.32□□□□□ -0.287e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-204ENST00000460394 873 ntTSL 39.85□□□□□ -0.837e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-202ENST00000371092 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.917e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-213ENST00000489863 619 ntTSL 38.8□□□□□ -17e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.047e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-206ENST00000462285 657 ntTSL 28.43□□□□□ -1.067e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-203ENST00000460251 1012 ntTSL 38.05□□□□□ -1.127e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 ITGB3BP-208ENST00000465781 1025 ntTSL 36.68□□□□□ -1.347e-9■■■■■ 888.9
UTP3Q9NQZ2 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 887.4
UTP3Q9NQZ2 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.792e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 CEP250-205ENST00000425096 629 ntTSL 318.36■□□□□ 0.534e-19■■■■■ 881.9
UTP3Q9NQZ2 CANT1-207ENST00000588611 900 ntTSL 312.61□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 875.7
UTP3Q9NQZ2 CARM1-206ENST00000588947 468 ntTSL 531.75■■■□□ 2.673e-10■■■■■ 873.6
UTP3Q9NQZ2 CARM1-208ENST00000590039 596 ntTSL 511.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 869.5
UTP3Q9NQZ2 CARM1-207ENST00000589693 601 ntTSL 511.59□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 869.5
UTP3Q9NQZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.832e-47■■■■■ 866.4
UTP3Q9NQZ2 MOB2-203ENST00000526698 608 ntTSL 322.42■■□□□ 1.182e-47■■■■■ 866.4
UTP3Q9NQZ2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.622e-47■■■■■ 866.4
UTP3Q9NQZ2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-47■■■■■ 866.4
UTP3Q9NQZ2 PAPD5-204ENST00000562717 1866 ntTSL 515.12■□□□□ 0.012e-47■■■■■ 866.4
UTP3Q9NQZ2 LRFN4-203ENST00000531590 274 ntTSL 317.53■□□□□ 0.49e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 316.24■□□□□ 0.199e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 315.98■□□□□ 0.159e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 SNX29-203ENST00000564111 2248 ntTSL 215.64■□□□□ 0.099e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 314.9□□□□□ -0.029e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.049e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 SNX29-207ENST00000568949 636 ntTSL 313.2□□□□□ -0.39e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 AC078846.1-201ENST00000608694 7083 ntBASIC12.78□□□□□ -0.369e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF571-206ENST00000593133 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.469e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF561-201ENST00000302851 4693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.629e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF561-202ENST00000326044 2017 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.739e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF561-209ENST00000444802 912 ntTSL 59.04□□□□□ -0.969e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 EXPH5-204ENST00000526312 5495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.989e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 SNX29-208ENST00000569801 540 ntTSL 48.71□□□□□ -1.029e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.039e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.129e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.399e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.49e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.489e-36■■■■■ 857.1
UTP3Q9NQZ2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 856.9
UTP3Q9NQZ2 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 856.9
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-206ENST00000488969 506 ntTSL 419.12■□□□□ 0.656e-12■■■■■ 852.7
UTP3Q9NQZ2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.898e-46■■■■■ 838.4
UTP3Q9NQZ2 VGLL4-217ENST00000480288 586 ntTSL 49.86□□□□□ -0.832e-34■■■■■ 838.4
UTP3Q9NQZ2 PLIN2-205ENST00000464326 790 ntTSL 29.21□□□□□ -0.948e-46■■■■■ 838.4
UTP3Q9NQZ2 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.474e-14■■■■■ 836.9
UTP3Q9NQZ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.018e-40■■■■■ 832.2
UTP3Q9NQZ2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.588e-40■■■■■ 832.2
UTP3Q9NQZ2 THEM4-202ENST00000471464 1832 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.468e-40■■■■■ 832.2
UTP3Q9NQZ2 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.196e-12■■■■■ 825.8
UTP3Q9NQZ2 CTCF-203ENST00000566078 1627 ntTSL 233.02■■■□□ 2.883e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.613e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.393e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.283e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.273e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 HERC3-214ENST00000601319 1298 ntTSL 218.24■□□□□ 0.513e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 WDR25-211ENST00000557710 1751 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.173e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL5-207ENST00000515612 909 ntTSL 510.89□□□□□ -0.673e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 CLYBL-201ENST00000339105 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 PHACTR1-210ENST00000489548 568 ntTSL 59.88□□□□□ -0.833e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.893e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.133e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.213e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-34■■■■■ 819.8
UTP3Q9NQZ2 NCKAP5L-204ENST00000480927 533 ntTSL 419.06■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 812
UTP3Q9NQZ2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 812
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