Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC28BQ9BUN5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC28BQ9BUN5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC28BQ9BUN5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC28BQ9BUN5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC28BQ9BUN5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC28BQ9BUN5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC28BQ9BUN5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC28BQ9BUN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC28BQ9BUN5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC28BQ9BUN5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC28BQ9BUN5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC28BQ9BUN5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC28BQ9BUN5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC28BQ9BUN5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC28BQ9BUN5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC28BQ9BUN5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC28BQ9BUN5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC28BQ9BUN5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC28BQ9BUN5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC28BQ9BUN5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC28BQ9BUN5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC28BQ9BUN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms