Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD6Q9BRQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD6Q9BRQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD6Q9BRQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD6Q9BRQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD6Q9BRQ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHCHD6Q9BRQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD6Q9BRQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD6Q9BRQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD6Q9BRQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHCHD6Q9BRQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD6Q9BRQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD6Q9BRQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD6Q9BRQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD6Q9BRQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD6Q9BRQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD6Q9BRQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD6Q9BRQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms