Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TSC1Q92574 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TSC1Q92574 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TSC1Q92574 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TSC1Q92574 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TSC1Q92574 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TSC1Q92574 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSC1Q92574 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TSC1Q92574 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TSC1Q92574 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSC1Q92574 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TSC1Q92574 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TSC1Q92574 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSC1Q92574 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSC1Q92574 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSC1Q92574 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSC1Q92574 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSC1Q92574 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
TSC1Q92574 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSC1Q92574 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TSC1Q92574 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSC1Q92574 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSC1Q92574 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSC1Q92574 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSC1Q92574 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSC1Q92574 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSC1Q92574 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TSC1Q92574 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSC1Q92574 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSC1Q92574 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSC1Q92574 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSC1Q92574 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSC1Q92574 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSC1Q92574 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms