Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSKUQ8WUA8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSKUQ8WUA8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSKUQ8WUA8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSKUQ8WUA8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSKUQ8WUA8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSKUQ8WUA8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSKUQ8WUA8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSKUQ8WUA8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSKUQ8WUA8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSKUQ8WUA8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSKUQ8WUA8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSKUQ8WUA8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSKUQ8WUA8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms