Protein–RNA interactions for Protein: Q8NES3

LFNG, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LFNGQ8NES3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LFNGQ8NES3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LFNGQ8NES3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LFNGQ8NES3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LFNGQ8NES3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LFNGQ8NES3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LFNGQ8NES3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LFNGQ8NES3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LFNGQ8NES3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms