Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 MVD-215ENST00000568133 853 ntTSL 318.14■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 512.06□□□□□ -0.488e-8■■■■■ 46.1
PHF6Q8IWS0 FADS1-218ENST00000544696 567 ntTSL 322.36■■□□□ 1.177e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.097e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-212ENST00000598999 409 ntTSL 219.99■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 219.72■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 PRDM10-206ENST00000527581 620 ntTSL 318.37■□□□□ 0.537e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 LINC01667-201ENST00000623554 1137 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 510.02□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 PRDM10-208ENST00000531431 528 ntTSL 46.11□□□□□ -1.437e-7■■■■■ 45.9
PHF6Q8IWS0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 45.7
PHF6Q8IWS0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 517.22■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 05e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 215□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 45
PHF6Q8IWS0 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 44.9
PHF6Q8IWS0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 44.9
PHF6Q8IWS0 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 44.9
PHF6Q8IWS0 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 44.9
PHF6Q8IWS0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 44.9
PHF6Q8IWS0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 44.9
PHF6Q8IWS0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.84e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 325.08■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 424.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 324.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 322.48■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 322.25■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 SLC22A18-210ENST00000492567 684 ntTSL 222.21■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 522.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 422.04■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 421.37■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 221.29■■□□□ 12e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ANAPC2-207ENST00000495611 747 ntTSL 220.11■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 318.69■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 318.33■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 CENPF-202ENST00000464322 689 ntTSL 217.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-204ENST00000478545 576 ntTSL 417.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 TSNARE1-203ENST00000518928 940 ntTSL 316.28■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 UVSSA-203ENST00000503548 4819 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 515.31■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 414.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 CENPF-205ENST00000495259 345 ntTSL 313.9□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 39.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 36.42□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.811e-26■■■■■ 44.4
PHF6Q8IWS0 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 315.61■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 44
PHF6Q8IWS0 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 514.87□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 44
PHF6Q8IWS0 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 411.22□□□□□ -0.613e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.87□□□□□ -0.833e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.023e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.87□□□□□ -1.153e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 27.29□□□□□ -1.243e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 46.93□□□□□ -1.33e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.573e-24■■■■■ 43.9
PHF6Q8IWS0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 43.7
PHF6Q8IWS0 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 219.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 43.7
PHF6Q8IWS0 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 43.7
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