Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATXN8Q156A1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATXN8Q156A1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATXN8Q156A1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATXN8Q156A1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATXN8Q156A1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATXN8Q156A1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATXN8Q156A1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATXN8Q156A1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATXN8Q156A1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8Q156A1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATXN8Q156A1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATXN8Q156A1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATXN8Q156A1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATXN8Q156A1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms