Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.067e-8■■■■■ 40.6
WDR43Q15061 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 39.8
WDR43Q15061 EIF4G1-235ENST00000482303 493 ntTSL 218.23■□□□□ 0.513e-9■■■■■ 39.8
WDR43Q15061 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 39.8
WDR43Q15061 EIF4G1-225ENST00000448284 677 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 39.8
WDR43Q15061 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 39.8
WDR43Q15061 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 39.8
WDR43Q15061 MRPS31P5-202ENST00000423686 920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 39
WDR43Q15061 MRPS31P5-204ENST00000606974 551 ntTSL 410.87□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 39
WDR43Q15061 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 39
WDR43Q15061 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 39
WDR43Q15061 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 334.53■■■■□ 3.122e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 NADK-205ENST00000460602 974 ntTSL 234.53■■■■□ 3.122e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.472e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 223.11■■□□□ 1.292e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 NADK-203ENST00000342348 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.26■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 319.56■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 38.9
WDR43Q15061 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.571e-323■■■■■ 38.8
WDR43Q15061 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LCORL-206ENST00000512376 500 ntTSL 523.71■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 218.05■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 HCG18-246ENST00000602591 1976 nt15.81■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 ZNF276-206ENST00000563983 3403 ntTSL 215.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 513.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 AC087633.2-204ENST00000621842 496 ntTSL 513.38□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 512.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 59.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 AC087633.2-205ENST00000615751 500 ntTSL 58.73□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 AC087633.2-207ENST00000616940 698 ntTSL 55.6□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 55.57□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.013e-6■■■■■ 38.4
WDR43Q15061 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.74□□□□□ -1.651e-323■■■■■ 38.1
WDR43Q15061 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.17e-84■■■■■ 36.9
WDR43Q15061 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt14.88□□□□□ -0.037e-84■■■■■ 36.9
WDR43Q15061 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt14.76□□□□□ -0.057e-84■■■■■ 36.9
WDR43Q15061 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.962e-6■■■■■ 35.3
WDR43Q15061 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.71e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 SREBF2-203ENST00000435061 770 ntTSL 322.67■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 PLCG1-212ENST00000492148 597 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 35
WDR43Q15061 STK3-202ENST00000424861 2065 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 34.8
WDR43Q15061 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 34.8
WDR43Q15061 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 34.8
WDR43Q15061 STK3-211ENST00000521649 574 ntTSL 414.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 34.8
WDR43Q15061 STK3-204ENST00000518165 817 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 34.8
WDR43Q15061 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 34.8
WDR43Q15061 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.71e-323■■■■■ 34
WDR43Q15061 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 EHMT2-208ENST00000465429 1454 ntTSL 233.44■■■□□ 2.942e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 32.2
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.229e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.779e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.719e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 225.65■■□□□ 1.79e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 224■■□□□ 1.439e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 323.79■■□□□ 1.49e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 323■■□□□ 1.279e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 422.27■■□□□ 1.169e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.469e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 517.77■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 516.88■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 216.82■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 31.8
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 199.3 ms