Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 YMR147WYMR147W 672 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 RSB1YOR049C 1065 nt10.26□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 YDL157CYDL157C 357 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 PUS5YLR165C 765 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 NEJ1YLR265C 1029 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 YLR311CYLR311C 348 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 ATG17YLR423C 1254 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 RUF21RUF21 707 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 BOP3YNL042W 1191 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 YPR1YDR368W 939 nt10.24□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 VPS28YPL065W 729 nt10.24□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 FHN1YGR131W 525 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 DIA1YMR316W 1011 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 SIS1YNL007C 1059 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 GFD2YCL036W 1701 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 COX16YJL003W 357 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 TSR2YLR435W 618 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 ALF1YNL148C 765 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 YNL040WYNL040W 1371 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 SUA5YGL169W 1281 nt10.21□□□□□ -0.77
TY1A-NL2Q12470 YHR054CYHR054C 1065 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 FAF1YIL019W 1041 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 BOR1YNL275W 1731 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 SCO2YBR024W 906 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 NCP1YHR042W 2076 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 GET2YER083C 858 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 BDH2YAL061W 1254 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 RTS2YOR077W 699 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 AME1YBR211C 975 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 ART5YGR068C 1761 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 PEX34YCL056C 435 nt10.17□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt10.15□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 NDJ1YOL104C 1059 nt10.15□□□□□ -0.78
TY1A-NL2Q12470 PCL10YGL134W 1302 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 RSA3YLR221C 663 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 YMR074CYMR074C 438 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 YJL225CYJL225C 5277 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 TAF4YMR005W 1167 nt10.11□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 AQY1YPR192W 918 nt10.11□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 YGR011WYGR011W 327 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 TAZ1YPR140W 1146 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 GAT1YFL021W 1533 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 CCT6YDR188W 1641 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 TRM9YML014W 840 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1A-NL2Q12470 YDL158CYDL158C 309 nt10.07□□□□□ -0.8
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TY1A-NL2Q12470 YJR056CYJR056C 711 nt10.06□□□□□ -0.8
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TY1A-NL2Q12470 PRM4YPL156C 855 nt9.98□□□□□ -0.81
TY1A-NL2Q12470 MMS21YEL019C 804 nt9.97□□□□□ -0.81
TY1A-NL2Q12470 CSI1YMR025W 888 nt9.97□□□□□ -0.81
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TY1A-NL2Q12470 YNL195CYNL195C 786 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-NL2Q12470 YNL303WYNL303W 348 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-NL2Q12470 YNL319WYNL319W 441 nt9.94□□□□□ -0.82
TY1A-NL2Q12470 YOL107WYOL107W 1029 nt9.94□□□□□ -0.82
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TY1A-NL2Q12470 SIR2YDL042C 1689 nt9.93□□□□□ -0.82
TY1A-NL2Q12470 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.93□□□□□ -0.82
TY1A-NL2Q12470 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.93□□□□□ -0.82
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TY1A-NL2Q12470 snR189snR189 189 nt9.89□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 HAS1YMR290C 1518 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 YER147C-AYER147C-A 411 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 LYS12YIL094C 1116 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 MIX17YMR002W 471 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 KDX1YKL161C 1302 nt9.87□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 LSM3YLR438C-A 270 nt9.87□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 IRC14YOR135C 342 nt9.86□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 WWM1YFL010C 636 nt9.85□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 RPM1RPM1 483 nt9.85□□□□□ -0.83
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TY1A-NL2Q12470 RER1YCL001W 567 nt9.84□□□□□ -0.83
TY1A-NL2Q12470 YIL100WYIL100W 354 nt9.83□□□□□ -0.84
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