Protein–RNA interactions for Protein: Q12380

ATG5, Autophagy protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG5Q12380 TRM5YHR070W 1500 nt9.12□□□□□ -0.95
ATG5Q12380 FUR4YBR021W 1902 nt9.1□□□□□ -0.95
ATG5Q12380 RAX1YOR301W 1308 nt9.08□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 CCA1YER168C 1641 nt9.08□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 DDR2YOL052C-A 186 nt9.07□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.06□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 ANP1YEL036C 1503 nt9.05□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 AQY1YPR192W 918 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 AAC1YMR056C 930 nt9.03□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 SPP1YPL138C 1062 nt9.03□□□□□ -0.96
ATG5Q12380 PRP4YPR178W 1398 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 PTH1YHR189W 573 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 YEL076CYEL076C 651 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 YLR235CYLR235C 399 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 YLR464WYLR464W 651 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 TIM23YNR017W 669 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 SPC25YER018C 666 nt8.98□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 STB1YNL309W 1263 nt8.98□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 MIC12YBR262C 321 nt8.98□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 DPS1YLL018C 1674 nt8.97□□□□□ -0.97
ATG5Q12380 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 YLR179CYLR179C 606 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 FEN2YCR028C 1539 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 CMP2YML057W 1815 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 HSL7YBR133C 2484 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 BNA2YJR078W 1362 nt8.93□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 AGP1YCL025C 1902 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 GPI16YHR188C 1833 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 WSC2YNL283C 1512 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 MOT3YMR070W 1473 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 BIO5YNR056C 1686 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 AHT1YHR093W 549 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG5Q12380 VPS60YDR486C 690 nt8.89□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 PBP1YGR178C 2169 nt8.88□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 CCT4YDL143W 1587 nt8.88□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 YIR016WYIR016W 798 nt8.88□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 YKL030WYKL030W 606 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 BMT6YLR063W 1098 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 SNF1YDR477W 1902 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 ALG3YBL082C 1377 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 CYT2YKL087C 675 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 HHO1YPL127C 777 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG5Q12380 YKR005CYKR005C 1578 nt8.83□□□□□ -1
ATG5Q12380 YCL074WYCL074W 927 nt8.81□□□□□ -1
ATG5Q12380 YPR064WYPR064W 420 nt8.81□□□□□ -1
ATG5Q12380 YGR201CYGR201C 678 nt8.8□□□□□ -1
ATG5Q12380 XDJ1YLR090W 1380 nt8.8□□□□□ -1
ATG5Q12380 DUS1YML080W 1272 nt8.79□□□□□ -1
ATG5Q12380 SWC5YBR231C 912 nt8.79□□□□□ -1
ATG5Q12380 TAD3YLR316C 969 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 HEL2YDR266C 1920 nt8.76□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.75□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.75□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 RTG1YOL067C 534 nt8.74□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.73□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.73□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 YGR259CYGR259C 441 nt8.73□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 DUT1YBR252W 444 nt8.73□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 IRC24YIR036C 792 nt8.72□□□□□ -1.01
ATG5Q12380 STR3YGL184C 1398 nt8.71□□□□□ -1.02
ATG5Q12380 BDH1YAL060W 1149 nt8.7□□□□□ -1.02
ATG5Q12380 GDH3YAL062W 1374 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG5Q12380 AVT6YER119C 1347 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG5Q12380 YAT1YAR035W 2064 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 YLR415CYLR415C 339 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 GOR1YNL274C 1053 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 NDI1YML120C 1542 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 SHM2YLR058C 1410 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 AQY2YLL052C 450 nt8.6□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 YSP3YOR003W 1437 nt8.59□□□□□ -1.03
ATG5Q12380 RTN2YDL204W 1182 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG5Q12380 NIT1YIL164C 600 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG5Q12380 TIM17YJL143W 477 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG5Q12380 HUA1YGR268C 597 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG5Q12380 DAT1YML113W 747 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG5Q12380 RPM1RPM1 483 nt8.52□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 MET2YNL277W 1461 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 RIM8YGL045W 1629 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 SPT20YOL148C 1815 nt8.48□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 NBP35YGL091C 987 nt8.48□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 SGT2YOR007C 1041 nt8.47□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 YNL115CYNL115C 1935 nt8.46□□□□□ -1.05
ATG5Q12380 MRPL8YJL063C 717 nt8.46□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 YCR102CYCR102C 1107 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 PEX25YPL112C 1185 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 ARP6YLR085C 1317 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 SFP1YLR403W 2052 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 PLB1YMR008C 1995 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 MAE1YKL029C 2010 nt8.42□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 ADO1YJR105W 1023 nt8.42□□□□□ -1.06
ATG5Q12380 YGL114WYGL114W 2178 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG5Q12380 RPC82YPR190C 1965 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG5Q12380 VPS75YNL246W 795 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG5Q12380 YFL066CYFL066C 1179 nt8.38□□□□□ -1.07
ATG5Q12380 INA1YLR413W 2028 nt8.37□□□□□ -1.07
ATG5Q12380 PRM5YIL117C 957 nt8.35□□□□□ -1.07
ATG5Q12380 YFR018CYFR018C 1092 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG5Q12380 HIF1YLL022C 1158 nt8.33□□□□□ -1.08
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