Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 NCP1YHR042W 2076 nt11.44□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 RTF1YGL244W 1677 nt11.43□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 SNF6YHL025W 999 nt11.43□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 URH1YDR400W 1023 nt11.4□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 Q0255Q0255 1419 nt11.4□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 BOP3YNL042W 1191 nt11.39□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 SIM1YIL123W 1431 nt11.38□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 HMT1YBR034C 1047 nt11.38□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 PTH1YHR189W 573 nt11.35□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 BIO4YNR057C 714 nt11.35□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 YNR068CYNR068C 819 nt11.35□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 YIH1YCR059C 777 nt11.34□□□□□ -0.59
BUD20Q08004 YOR169CYOR169C 465 nt11.3□□□□□ -0.6
BUD20Q08004 YPL071CYPL071C 471 nt11.3□□□□□ -0.6
BUD20Q08004 RNQ1YCL028W 1218 nt11.3□□□□□ -0.6
BUD20Q08004 PTK1YKL198C 1989 nt11.3□□□□□ -0.6
BUD20Q08004 DIC1YLR348C 897 nt11.29□□□□□ -0.6
BUD20Q08004 RTG1YOL067C 534 nt11.28□□□□□ -0.6
BUD20Q08004 YGL188CYGL188C 174 nt11.27□□□□□ -0.61
BUD20Q08004 YLL053CYLL053C 459 nt11.26□□□□□ -0.61
BUD20Q08004 YLR235CYLR235C 399 nt11.25□□□□□ -0.61
BUD20Q08004 YPL168WYPL168W 1293 nt11.25□□□□□ -0.61
BUD20Q08004 LYS4YDR234W 2082 nt11.21□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 ATP6Q0085 780 nt11.19□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 YKL030WYKL030W 606 nt11.18□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 AIR1YIL079C 1083 nt11.17□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 TIM23YNR017W 669 nt11.17□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 FTR1YER145C 1215 nt11.16□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.15□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 YEL076CYEL076C 651 nt11.15□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 YLR464WYLR464W 651 nt11.15□□□□□ -0.62
BUD20Q08004 ATF2YGR177C 1608 nt11.14□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 ERF2YLR246W 1080 nt11.14□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 GAL1YBR020W 1587 nt11.14□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 MRPL8YJL063C 717 nt11.13□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 CRR1YLR213C 1269 nt11.13□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 URE2YNL229C 1065 nt11.13□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 YJL118WYJL118W 660 nt11.12□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 YLR179CYLR179C 606 nt11.12□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 YHM2YMR241W 945 nt11.12□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.12□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 TRM5YHR070W 1500 nt11.11□□□□□ -0.63
BUD20Q08004 PAC11YDR488C 1602 nt11.08□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 YFL054CYFL054C 1941 nt11.07□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 WSC2YNL283C 1512 nt11.05□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 MIC10YCL057C-A 294 nt11.05□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 YFL067WYFL067W 528 nt11.04□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 AHT1YHR093W 549 nt11.03□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 AQY1YPR192W 918 nt11.03□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 KTR3YBR205W 1215 nt11.03□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 SNG1YGR197C 1644 nt11.02□□□□□ -0.64
BUD20Q08004 ADO1YJR105W 1023 nt11.02□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 DDR2YOL052C-A 186 nt11.02□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 HUA1YGR268C 597 nt11.01□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 HEM12YDR047W 1089 nt11□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 STB1YNL309W 1263 nt10.99□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.98□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 YPR064WYPR064W 420 nt10.98□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 SPC25YER018C 666 nt10.97□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 NEM1YHR004C 1341 nt10.97□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 SPT8YLR055C 1809 nt10.97□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 NVJ2YPR091C 2313 nt10.96□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.96□□□□□ -0.65
BUD20Q08004 YJL107CYJL107C 1164 nt10.95□□□□□ -0.66
BUD20Q08004 ANP1YEL036C 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
BUD20Q08004 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.94□□□□□ -0.66
BUD20Q08004 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt10.94□□□□□ -0.66
BUD20Q08004 TAD3YLR316C 969 nt10.93□□□□□ -0.66
BUD20Q08004 CCT4YDL143W 1587 nt10.9□□□□□ -0.66
BUD20Q08004 FEN2YCR028C 1539 nt10.89□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 GPI16YHR188C 1833 nt10.89□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 VPS60YDR486C 690 nt10.89□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.88□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 THP3YPR045C 1413 nt10.88□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 RSM23YGL129C 1353 nt10.87□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 ALG3YBL082C 1377 nt10.87□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 STD1YOR047C 1335 nt10.86□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 SWE1YJL187C 2460 nt10.84□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 LSM12YHR121W 564 nt10.84□□□□□ -0.67
BUD20Q08004 YEL074WYEL074W 339 nt10.83□□□□□ -0.68
BUD20Q08004 RAX1YOR301W 1308 nt10.83□□□□□ -0.68
BUD20Q08004 BDH1YAL060W 1149 nt10.82□□□□□ -0.68
BUD20Q08004 SWC5YBR231C 912 nt10.81□□□□□ -0.68
BUD20Q08004 YIR016WYIR016W 798 nt10.8□□□□□ -0.68
BUD20Q08004 AST1YBL069W 1290 nt10.79□□□□□ -0.68
BUD20Q08004 YHL044WYHL044W 708 nt10.77□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 PEX27YOR193W 1131 nt10.77□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 MIC12YBR262C 321 nt10.76□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 PHO92YDR374C 921 nt10.75□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 BNA2YJR078W 1362 nt10.75□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 YSP3YOR003W 1437 nt10.74□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 YLR415CYLR415C 339 nt10.73□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 CCA1YER168C 1641 nt10.73□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 YLR036CYLR036C 612 nt10.71□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 MOD5YOR274W 1287 nt10.71□□□□□ -0.69
BUD20Q08004 YGL118CYGL118C 438 nt10.68□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 UBX6YJL048C 1191 nt10.68□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 YDR094WYDR094W 336 nt10.67□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 YFL066CYFL066C 1179 nt10.66□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 YPL041CYPL041C 624 nt10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms