Protein–RNA interactions for Protein: Q06147

LCB5, Sphingoid long chain base kinase 5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB5Q06147 CWP1YKL096W 720 nt11.43□□□□□ -0.58
LCB5Q06147 GLK1YCL040W 1503 nt11.41□□□□□ -0.58
LCB5Q06147 ADH2YMR303C 1047 nt11.38□□□□□ -0.59
LCB5Q06147 Q0144Q0144 330 nt11.32□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 REG2YBR050C 1017 nt11.32□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 SNF6YHL025W 999 nt11.31□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 LYS4YDR234W 2082 nt11.31□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 PCM1YEL058W 1674 nt11.3□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 DIC1YLR348C 897 nt11.3□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 TIM23YNR017W 669 nt11.3□□□□□ -0.6
LCB5Q06147 BUR6YER159C 429 nt11.26□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 BMT5YIL096C 1011 nt11.24□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 FUR4YBR021W 1902 nt11.23□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.22□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 NAR1YNL240C 1476 nt11.22□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 YLR179CYLR179C 606 nt11.21□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 RNQ1YCL028W 1218 nt11.21□□□□□ -0.61
LCB5Q06147 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.2□□□□□ -0.62
LCB5Q06147 YIH1YCR059C 777 nt11.19□□□□□ -0.62
LCB5Q06147 BIO4YNR057C 714 nt11.19□□□□□ -0.62
LCB5Q06147 YPR064WYPR064W 420 nt11.18□□□□□ -0.62
LCB5Q06147 SIM1YIL123W 1431 nt11.17□□□□□ -0.62
LCB5Q06147 AAC1YMR056C 930 nt11.16□□□□□ -0.62
LCB5Q06147 PRP4YPR178W 1398 nt11.15□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 YFR018CYFR018C 1092 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 SEM1YDR363W-A 270 nt11.11□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 TAD3YLR316C 969 nt11.11□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 Q0142Q0142 177 nt11.1□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 DPS1YLL018C 1674 nt11.09□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 WSC2YNL283C 1512 nt11.09□□□□□ -0.63
LCB5Q06147 AHT1YHR093W 549 nt11.08□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 RRT5YFR032C 870 nt11.07□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 PAU16YKL224C 372 nt11.07□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 Q0017Q0017 162 nt11.07□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 YLL053CYLL053C 459 nt11.06□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 AQY1YPR192W 918 nt11.06□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 BIO5YNR056C 1686 nt11.02□□□□□ -0.64
LCB5Q06147 PBP1YGR178C 2169 nt11.02□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 FTR1YER145C 1215 nt11.02□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 Q0010Q0010 387 nt11.02□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 PRE6YOL038W 765 nt10.99□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 GAL1YBR020W 1587 nt10.98□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 CCA1YER168C 1641 nt10.96□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.96□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 CYT2YKL087C 675 nt10.96□□□□□ -0.65
LCB5Q06147 BMT6YLR063W 1098 nt10.95□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 SNF1YDR477W 1902 nt10.95□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 TRM5YHR070W 1500 nt10.94□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 PEX25YPL112C 1185 nt10.93□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.92□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 SRN2YLR119W 642 nt10.91□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 CMP2YML057W 1815 nt10.91□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 YKR005CYKR005C 1578 nt10.9□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 ERF2YLR246W 1080 nt10.9□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 STB1YNL309W 1263 nt10.9□□□□□ -0.66
LCB5Q06147 SPC25YER018C 666 nt10.89□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 BDH1YAL060W 1149 nt10.89□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 CRR1YLR213C 1269 nt10.89□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 YLR415CYLR415C 339 nt10.89□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 YFL066CYFL066C 1179 nt10.88□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 YFL067WYFL067W 528 nt10.88□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 DDR2YOL052C-A 186 nt10.88□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 CCT4YDL143W 1587 nt10.87□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 YSP3YOR003W 1437 nt10.87□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 GPI16YHR188C 1833 nt10.87□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 ATF2YGR177C 1608 nt10.87□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 RAX1YOR301W 1308 nt10.86□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.86□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 HSL7YBR133C 2484 nt10.85□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 YNL115CYNL115C 1935 nt10.84□□□□□ -0.67
LCB5Q06147 SWC5YBR231C 912 nt10.83□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.81□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 SBA1YKL117W 651 nt10.81□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.8□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 HEM12YDR047W 1089 nt10.8□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 NAT4YMR069W 858 nt10.8□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 VPS60YDR486C 690 nt10.79□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 MIC10YCL057C-A 294 nt10.79□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 IRC24YIR036C 792 nt10.78□□□□□ -0.68
LCB5Q06147 FEN2YCR028C 1539 nt10.75□□□□□ -0.69
LCB5Q06147 ANP1YEL036C 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
LCB5Q06147 YGR259CYGR259C 441 nt10.74□□□□□ -0.69
LCB5Q06147 SNG1YGR197C 1644 nt10.73□□□□□ -0.69
LCB5Q06147 VPS75YNL246W 795 nt10.72□□□□□ -0.69
LCB5Q06147 ALG3YBL082C 1377 nt10.72□□□□□ -0.69
LCB5Q06147 Q0255Q0255 1419 nt10.7□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 ARP10YDR106W 855 nt10.7□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 ARA2YMR041C 1008 nt10.7□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 MSF1YPR047W 1410 nt10.67□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 AI3Q0060 1248 nt10.67□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 MIR1YJR077C 936 nt10.67□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 YAT1YAR035W 2064 nt10.67□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.66□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.66□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 YCL074WYCL074W 927 nt10.66□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 THI74YDR438W 1113 nt10.66□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 YCR099CYCR099C 468 nt10.65□□□□□ -0.7
LCB5Q06147 YIR016WYIR016W 798 nt10.64□□□□□ -0.71
LCB5Q06147 NDI1YML120C 1542 nt10.63□□□□□ -0.71
LCB5Q06147 TIM17YJL143W 477 nt10.61□□□□□ -0.71
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