Protein–RNA interactions for Protein: Q05788

PNP1, Purine nucleoside phosphorylase, yeastyeast

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNP1Q05788 YFL067WYFL067W 528 nt11.35□□□□□ -0.59
PNP1Q05788 HSP60YLR259C 1719 nt11.33□□□□□ -0.6
PNP1Q05788 CCA1YER168C 1641 nt11.31□□□□□ -0.6
PNP1Q05788 PTH1YHR189W 573 nt11.3□□□□□ -0.6
PNP1Q05788 ARO7YPR060C 771 nt11.3□□□□□ -0.6
PNP1Q05788 RAX1YOR301W 1308 nt11.3□□□□□ -0.6
PNP1Q05788 DDR2YOL052C-A 186 nt11.28□□□□□ -0.6
PNP1Q05788 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.27□□□□□ -0.61
PNP1Q05788 ANP1YEL036C 1503 nt11.26□□□□□ -0.61
PNP1Q05788 FUR4YBR021W 1902 nt11.25□□□□□ -0.61
PNP1Q05788 GLK1YCL040W 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
PNP1Q05788 AQY1YPR192W 918 nt11.21□□□□□ -0.61
PNP1Q05788 YLR235CYLR235C 399 nt11.2□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 TIM23YNR017W 669 nt11.2□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 STB1YNL309W 1263 nt11.19□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 YJL225CYJL225C 5277 nt11.19□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 SPC25YER018C 666 nt11.18□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.17□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 YLR179CYLR179C 606 nt11.16□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 MIC12YBR262C 321 nt11.16□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 WSC2YNL283C 1512 nt11.15□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 AGP1YCL025C 1902 nt11.15□□□□□ -0.62
PNP1Q05788 FEN2YCR028C 1539 nt11.14□□□□□ -0.63
PNP1Q05788 AHT1YHR093W 549 nt11.11□□□□□ -0.63
PNP1Q05788 BNA2YJR078W 1362 nt11.09□□□□□ -0.63
PNP1Q05788 VPS60YDR486C 690 nt11.09□□□□□ -0.63
PNP1Q05788 GPI16YHR188C 1833 nt11.09□□□□□ -0.63
PNP1Q05788 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 YKL030WYKL030W 606 nt11.08□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 ALG3YBL082C 1377 nt11.07□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 CCT4YDL143W 1587 nt11.06□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 YIR016WYIR016W 798 nt11.05□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 YJR154WYJR154W 1041 nt11.05□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 Q0010Q0010 387 nt11.05□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 ALG12YNR030W 1656 nt11.04□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 PRP4YPR178W 1398 nt11.03□□□□□ -0.64
PNP1Q05788 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.02□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 YEL076CYEL076C 651 nt11.02□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 YLR464WYLR464W 651 nt11.02□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 HHO1YPL127C 777 nt10.98□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 XDJ1YLR090W 1380 nt10.98□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 DPS1YLL018C 1674 nt10.98□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 YPR064WYPR064W 420 nt10.97□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.96□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 RTG1YOL067C 534 nt10.96□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 SWC5YBR231C 912 nt10.96□□□□□ -0.65
PNP1Q05788 YKR005CYKR005C 1578 nt10.95□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 FRE6YLL051C 2139 nt10.95□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 YCL074WYCL074W 927 nt10.94□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 DUT1YBR252W 444 nt10.94□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 TAD3YLR316C 969 nt10.93□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 DUS1YML080W 1272 nt10.93□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 MCH5YOR306C 1566 nt10.92□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 AAC1YMR056C 930 nt10.92□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 YGR201CYGR201C 678 nt10.91□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.9□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.9□□□□□ -0.66
PNP1Q05788 SNF1YDR477W 1902 nt10.9□□□□□ -0.67
PNP1Q05788 BDH1YAL060W 1149 nt10.87□□□□□ -0.67
PNP1Q05788 REG2YBR050C 1017 nt10.85□□□□□ -0.67
PNP1Q05788 YGR259CYGR259C 441 nt10.84□□□□□ -0.67
PNP1Q05788 STR3YGL184C 1398 nt10.84□□□□□ -0.67
PNP1Q05788 BIO5YNR056C 1686 nt10.84□□□□□ -0.67
PNP1Q05788 BMT6YLR063W 1098 nt10.82□□□□□ -0.68
PNP1Q05788 AVT6YER119C 1347 nt10.78□□□□□ -0.68
PNP1Q05788 GDH3YAL062W 1374 nt10.77□□□□□ -0.68
PNP1Q05788 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.75□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 YLR415CYLR415C 339 nt10.75□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 NAR1YNL240C 1476 nt10.74□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 SHM2YLR058C 1410 nt10.74□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 YSP3YOR003W 1437 nt10.74□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 PAB1YER165W 1734 nt10.73□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 IRC24YIR036C 792 nt10.73□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 AQY2YLL052C 450 nt10.72□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 PBP1YGR178C 2169 nt10.72□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 GOR1YNL274C 1053 nt10.71□□□□□ -0.69
PNP1Q05788 NIT1YIL164C 600 nt10.67□□□□□ -0.7
PNP1Q05788 ARA2YMR041C 1008 nt10.67□□□□□ -0.7
PNP1Q05788 LCP5YER127W 1074 nt10.65□□□□□ -0.7
PNP1Q05788 HUA1YGR268C 597 nt10.65□□□□□ -0.7
PNP1Q05788 YLR122CYLR122C 378 nt10.65□□□□□ -0.7
PNP1Q05788 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.63□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.63□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 RTN2YDL204W 1182 nt10.63□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 TIM17YJL143W 477 nt10.63□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 URH1YDR400W 1023 nt10.62□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 DAT1YML113W 747 nt10.62□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 RPM1RPM1 483 nt10.62□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 CYT2YKL087C 675 nt10.61□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 YNL115CYNL115C 1935 nt10.59□□□□□ -0.71
PNP1Q05788 SGT2YOR007C 1041 nt10.58□□□□□ -0.72
PNP1Q05788 NBP35YGL091C 987 nt10.56□□□□□ -0.72
PNP1Q05788 PAM17YKR065C 594 nt10.56□□□□□ -0.72
PNP1Q05788 MRPL8YJL063C 717 nt10.55□□□□□ -0.72
PNP1Q05788 PEX25YPL112C 1185 nt10.54□□□□□ -0.72
PNP1Q05788 YFL066CYFL066C 1179 nt10.51□□□□□ -0.73
PNP1Q05788 TOM20YGR082W 552 nt10.51□□□□□ -0.73
PNP1Q05788 PLB1YMR008C 1995 nt10.51□□□□□ -0.73
PNP1Q05788 YCR102CYCR102C 1107 nt10.5□□□□□ -0.73
PNP1Q05788 ARP6YLR085C 1317 nt10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms