Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 AGP1YCL025C 1902 nt9.88□□□□□ -0.83
RAI1P53063 MXR2YCL033C 507 nt9.87□□□□□ -0.83
RAI1P53063 FTR1YER145C 1215 nt9.86□□□□□ -0.83
RAI1P53063 YGR259CYGR259C 441 nt9.86□□□□□ -0.83
RAI1P53063 IRC24YIR036C 792 nt9.85□□□□□ -0.83
RAI1P53063 YCL042WYCL042W 360 nt9.85□□□□□ -0.83
RAI1P53063 CMP2YML057W 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
RAI1P53063 TRM5YHR070W 1500 nt9.84□□□□□ -0.83
RAI1P53063 YCL074WYCL074W 927 nt9.83□□□□□ -0.84
RAI1P53063 HSL7YBR133C 2484 nt9.83□□□□□ -0.84
RAI1P53063 GAL1YBR020W 1587 nt9.83□□□□□ -0.84
RAI1P53063 YDR433WYDR433W 441 nt9.81□□□□□ -0.84
RAI1P53063 DDR2YOL052C-A 186 nt9.8□□□□□ -0.84
RAI1P53063 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.79□□□□□ -0.84
RAI1P53063 DUS1YML080W 1272 nt9.79□□□□□ -0.84
RAI1P53063 MIC12YBR262C 321 nt9.79□□□□□ -0.84
RAI1P53063 ANP1YEL036C 1503 nt9.77□□□□□ -0.84
RAI1P53063 BNA2YJR078W 1362 nt9.77□□□□□ -0.84
RAI1P53063 FMP45YDL222C 930 nt9.77□□□□□ -0.85
RAI1P53063 FRD1YEL047C 1413 nt9.76□□□□□ -0.85
RAI1P53063 YAT1YAR035W 2064 nt9.76□□□□□ -0.85
RAI1P53063 YOR139CYOR139C 393 nt9.75□□□□□ -0.85
RAI1P53063 IMP2'YIL154C 1041 nt9.74□□□□□ -0.85
RAI1P53063 DIC1YLR348C 897 nt9.7□□□□□ -0.86
RAI1P53063 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
RAI1P53063 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
RAI1P53063 YPR011CYPR011C 981 nt9.69□□□□□ -0.86
RAI1P53063 HHO1YPL127C 777 nt9.67□□□□□ -0.86
RAI1P53063 XDJ1YLR090W 1380 nt9.65□□□□□ -0.86
RAI1P53063 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.65□□□□□ -0.86
RAI1P53063 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.65□□□□□ -0.86
RAI1P53063 STR3YGL184C 1398 nt9.63□□□□□ -0.87
RAI1P53063 FEN2YCR028C 1539 nt9.63□□□□□ -0.87
RAI1P53063 NDI1YML120C 1542 nt9.63□□□□□ -0.87
RAI1P53063 ERV46YAL042W 1248 nt9.63□□□□□ -0.87
RAI1P53063 YKR040CYKR040C 504 nt9.63□□□□□ -0.87
RAI1P53063 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.61□□□□□ -0.87
RAI1P53063 STB1YNL309W 1263 nt9.61□□□□□ -0.87
RAI1P53063 LPX1YOR084W 1164 nt9.61□□□□□ -0.87
RAI1P53063 SPC25YER018C 666 nt9.6□□□□□ -0.87
RAI1P53063 PUS2YGL063W 1113 nt9.6□□□□□ -0.87
RAI1P53063 AQY1YPR192W 918 nt9.6□□□□□ -0.87
RAI1P53063 DUT1YBR252W 444 nt9.6□□□□□ -0.87
RAI1P53063 CSM2YIL132C 642 nt9.58□□□□□ -0.88
RAI1P53063 YIR016WYIR016W 798 nt9.57□□□□□ -0.88
RAI1P53063 YGR201CYGR201C 678 nt9.53□□□□□ -0.88
RAI1P53063 GPI16YHR188C 1833 nt9.53□□□□□ -0.88
RAI1P53063 SPT20YOL148C 1815 nt9.53□□□□□ -0.88
RAI1P53063 VPS60YDR486C 690 nt9.51□□□□□ -0.89
RAI1P53063 AQY2YLL052C 450 nt9.49□□□□□ -0.89
RAI1P53063 RPC82YPR190C 1965 nt9.49□□□□□ -0.89
RAI1P53063 GDH3YAL062W 1374 nt9.49□□□□□ -0.89
RAI1P53063 ALG3YBL082C 1377 nt9.49□□□□□ -0.89
RAI1P53063 RTN2YDL204W 1182 nt9.48□□□□□ -0.89
RAI1P53063 MET8YBR213W 825 nt9.48□□□□□ -0.89
RAI1P53063 HEL2YDR266C 1920 nt9.47□□□□□ -0.89
RAI1P53063 CCT4YDL143W 1587 nt9.45□□□□□ -0.9
RAI1P53063 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.42□□□□□ -0.9
RAI1P53063 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.42□□□□□ -0.9
RAI1P53063 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.42□□□□□ -0.9
RAI1P53063 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
RAI1P53063 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.42□□□□□ -0.9
RAI1P53063 INA1YLR413W 2028 nt9.41□□□□□ -0.9
RAI1P53063 YLR179CYLR179C 606 nt9.41□□□□□ -0.9
RAI1P53063 TIM23YNR017W 669 nt9.41□□□□□ -0.9
RAI1P53063 AVT6YER119C 1347 nt9.39□□□□□ -0.91
RAI1P53063 CLB6YGR109C 1143 nt9.39□□□□□ -0.91
RAI1P53063 PTH1YHR189W 573 nt9.39□□□□□ -0.91
RAI1P53063 HIF1YLL022C 1158 nt9.39□□□□□ -0.91
RAI1P53063 GOR1YNL274C 1053 nt9.38□□□□□ -0.91
RAI1P53063 AHT1YHR093W 549 nt9.37□□□□□ -0.91
RAI1P53063 RIM8YGL045W 1629 nt9.36□□□□□ -0.91
RAI1P53063 SWC5YBR231C 912 nt9.36□□□□□ -0.91
RAI1P53063 SSN3YPL042C 1668 nt9.34□□□□□ -0.91
RAI1P53063 YLR235CYLR235C 399 nt9.31□□□□□ -0.92
RAI1P53063 PLB1YMR008C 1995 nt9.31□□□□□ -0.92
RAI1P53063 ALD4YOR374W 1560 nt9.3□□□□□ -0.92
RAI1P53063 PRM5YIL117C 957 nt9.3□□□□□ -0.92
RAI1P53063 MUP1YGR055W 1725 nt9.3□□□□□ -0.92
RAI1P53063 YGL114WYGL114W 2178 nt9.3□□□□□ -0.92
RAI1P53063 GID7YCL039W 2238 nt9.25□□□□□ -0.93
RAI1P53063 ARP6YLR085C 1317 nt9.23□□□□□ -0.93
RAI1P53063 MET2YNL277W 1461 nt9.22□□□□□ -0.93
RAI1P53063 HOL1YNR055C 1761 nt9.22□□□□□ -0.93
RAI1P53063 SFP1YLR403W 2052 nt9.22□□□□□ -0.93
RAI1P53063 PAU21YOR394W 495 nt9.2□□□□□ -0.94
RAI1P53063 PAU22YPL282C 495 nt9.2□□□□□ -0.94
RAI1P53063 NPP1YCR026C 2229 nt9.19□□□□□ -0.94
RAI1P53063 NBP35YGL091C 987 nt9.19□□□□□ -0.94
RAI1P53063 YPR064WYPR064W 420 nt9.19□□□□□ -0.94
RAI1P53063 SHM2YLR058C 1410 nt9.18□□□□□ -0.94
RAI1P53063 SPP1YPL138C 1062 nt9.18□□□□□ -0.94
RAI1P53063 MAE1YKL029C 2010 nt9.17□□□□□ -0.94
RAI1P53063 DAT1YML113W 747 nt9.16□□□□□ -0.94
RAI1P53063 ZRT3YKL175W 1512 nt9.15□□□□□ -0.94
RAI1P53063 TAD3YLR316C 969 nt9.14□□□□□ -0.95
RAI1P53063 UTR1YJR049C 1593 nt9.14□□□□□ -0.95
RAI1P53063 YKL030WYKL030W 606 nt9.13□□□□□ -0.95
RAI1P53063 FRE6YLL051C 2139 nt9.12□□□□□ -0.95
RAI1P53063 NIT1YIL164C 600 nt9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms