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Protein–RNA interactions for Protein: P52918
MSN5, Protein MSN5, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN5
P52918
FTR1
YER145C
1215 nt
13.2
□□□□□ -0.3
MSN5
P52918
YGL034C
YGL034C
366 nt
13.2
□□□□□ -0.3
MSN5
P52918
GAL1
YBR020W
1587 nt
13.17
□□□□□ -0.3
MSN5
P52918
CCT4
YDL143W
1587 nt
13.16
□□□□□ -0.3
MSN5
P52918
STB1
YNL309W
1263 nt
13.14
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
SPC25
YER018C
666 nt
13.13
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
SDH1
YKL148C
1923 nt
13.13
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
NDI1
YML120C
1542 nt
13.13
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
YBR220C
YBR220C
1683 nt
13.1
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
YGR139W
YGR139W
339 nt
13.1
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
TRM5
YHR070W
1500 nt
13.09
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
UBA4
YHR111W
1323 nt
13.09
□□□□□ -0.31
MSN5
P52918
PAU7
YAR020C
168 nt
13.08
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MSN5
P52918
BIO4
YNR057C
714 nt
13.08
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
SCC4
YER147C
1875 nt
13.08
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
SAM1
YLR180W
1149 nt
13.06
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
SWC5
YBR231C
912 nt
13.06
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
GPI16
YHR188C
1833 nt
13.05
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
13.05
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
SPT8
YLR055C
1809 nt
13.04
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
YMR226C
YMR226C
804 nt
13.03
□□□□□ -0.32
MSN5
P52918
VPS60
YDR486C
690 nt
13.02
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
RBG1
YAL036C
1110 nt
13.02
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
RPM1
RPM1
483 nt
13.02
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
YSR3
YKR053C
1215 nt
13
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
ALG3
YBL082C
1377 nt
12.97
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
SHB17
YKR043C
816 nt
12.97
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
XYL2
YLR070C
1071 nt
12.97
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
SIM1
YIL123W
1431 nt
12.96
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
RAD51
YER095W
1203 nt
12.96
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
YNL195C
YNL195C
786 nt
12.96
□□□□□ -0.33
MSN5
P52918
DDR2
YOL052C-A
186 nt
12.95
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MSN5
P52918
BDF1
YLR399C
2061 nt
12.9
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MSN5
P52918
YFL067W
YFL067W
528 nt
12.9
□□□□□ -0.34
MSN5
P52918
ATF2
YGR177C
1608 nt
12.9
□□□□□ -0.34
MSN5
P52918
FEN2
YCR028C
1539 nt
12.88
□□□□□ -0.35
MSN5
P52918
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
12.87
□□□□□ -0.35
MSN5
P52918
TIM17
YJL143W
477 nt
12.85
□□□□□ -0.35
MSN5
P52918
YCR087W
YCR087W
516 nt
12.83
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
YDR010C
YDR010C
333 nt
12.83
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
PAC11
YDR488C
1602 nt
12.82
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
ERF2
YLR246W
1080 nt
12.81
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
AIM45
YPR004C
1035 nt
12.81
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
ANP1
YEL036C
1503 nt
12.81
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
RRT12
YCR045C
1476 nt
12.79
□□□□□ -0.36
MSN5
P52918
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YNR029C
1290 nt
12.76
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
RET2
YFR051C
1641 nt
12.76
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
PHO89
YBR296C
1725 nt
12.76
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
NVJ2
YPR091C
2313 nt
12.75
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
YIR016W
YIR016W
798 nt
12.74
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
CRR1
YLR213C
1269 nt
12.73
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
TAT1
YBR069C
1860 nt
12.73
□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
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YLR111W
333 nt
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□□□□□ -0.37
MSN5
P52918
SHM2
YLR058C
1410 nt
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MSN5
P52918
STE4
YOR212W
1272 nt
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□□□□□ -0.38
MSN5
P52918
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YLR349W
507 nt
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□□□□□ -0.38
MSN5
P52918
YHL050C
YHL050C
2094 nt
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MSN5
P52918
SGT2
YOR007C
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□□□□□ -0.38
MSN5
P52918
SNG1
YGR197C
1644 nt
12.65
□□□□□ -0.38
MSN5
P52918
SEC11
YIR022W
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MSN5
P52918
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YDR405W
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□□□□□ -0.39
MSN5
P52918
NIT1
YIL164C
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□□□□□ -0.39
MSN5
P52918
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YDR047W
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MSN5
P52918
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YLR090W
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MSN5
P52918
COQ2
YNR041C
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□□□□□ -0.4
MSN5
P52918
NME1
NME1
340 nt
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□□□□□ -0.4
MSN5
P52918
ADH7
YCR105W
1086 nt
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□□□□□ -0.4
MSN5
P52918
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□□□□□ -0.4
MSN5
P52918
PAU15
YIR041W
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□□□□□ -0.4
MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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YAL008W
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□□□□□ -0.41
MSN5
P52918
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YLR437C-A
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MSN5
P52918
RAD23
YEL037C
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□□□□□ -0.41
MSN5
P52918
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YAL062W
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MSN5
P52918
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YOL071W
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MSN5
P52918
GUT2
YIL155C
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□□□□□ -0.42
MSN5
P52918
YLR279W
YLR279W
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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YBR031W
1089 nt
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□□□□□ -0.42
MSN5
P52918
YJL195C
YJL195C
702 nt
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□□□□□ -0.42
MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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YJL191W
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□□□□□ -0.43
MSN5
P52918
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YBR262C
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MSN5
P52918
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YJR078W
1362 nt
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
ESS1
YJR017C
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MSN5
P52918
YHL019W-A
YHL019W-A
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□□□□□ -0.44
MSN5
P52918
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□□□□□ -0.44
MSN5
P52918
YGR201C
YGR201C
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□□□□□ -0.44
MSN5
P52918
BOP3
YNL042W
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□□□□□ -0.44
MSN5
P52918
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YGL244W
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□□□□□ -0.44
MSN5
P52918
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1044 nt
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□□□□□ -0.45
MSN5
P52918
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YGR012W
1182 nt
12.25
□□□□□ -0.45
MSN5
P52918
tS(GCU)L
tS(GCU)L
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12.25
□□□□□ -0.45
MSN5
P52918
ADH1
YOL086C
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□□□□□ -0.45
MSN5
P52918
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YGL023C
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□□□□□ -0.45
MSN5
P52918
TSC10
YBR265W
963 nt
12.24
□□□□□ -0.45
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