Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCT5P48643 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCT5P48643 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCT5P48643 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCT5P48643 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCT5P48643 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCT5P48643 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCT5P48643 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCT5P48643 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCT5P48643 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCT5P48643 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCT5P48643 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCT5P48643 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCT5P48643 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCT5P48643 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCT5P48643 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCT5P48643 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCT5P48643 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCT5P48643 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCT5P48643 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCT5P48643 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCT5P48643 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCT5P48643 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCT5P48643 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCT5P48643 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCT5P48643 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCT5P48643 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCT5P48643 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCT5P48643 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCT5P48643 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCT5P48643 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCT5P48643 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCT5P48643 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCT5P48643 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCT5P48643 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT5P48643 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT5P48643 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT5P48643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCT5P48643 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCT5P48643 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT5P48643 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT5P48643 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT5P48643 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT5P48643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT5P48643 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT5P48643 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT5P48643 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT5P48643 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT5P48643 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT5P48643 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT5P48643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT5P48643 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT5P48643 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT5P48643 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT5P48643 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT5P48643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT5P48643 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT5P48643 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT5P48643 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT5P48643 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCT5P48643 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT5P48643 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT5P48643 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT5P48643 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT5P48643 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT5P48643 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT5P48643 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT5P48643 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT5P48643 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT5P48643 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCT5P48643 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCT5P48643 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCT5P48643 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT5P48643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT5P48643 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT5P48643 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT5P48643 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT5P48643 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT5P48643 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT5P48643 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT5P48643 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT5P48643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT5P48643 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT5P48643 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT5P48643 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCT5P48643 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT5P48643 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT5P48643 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT5P48643 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT5P48643 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT5P48643 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT5P48643 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT5P48643 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT5P48643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCT5P48643 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT5P48643 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT5P48643 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT5P48643 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT5P48643 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT5P48643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1210 ms