Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 AQY1YPR192W 918 nt10.01□□□□□ -0.81
MDE1P47095 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10□□□□□ -0.81
MDE1P47095 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10□□□□□ -0.81
MDE1P47095 HEM12YDR047W 1089 nt10□□□□□ -0.81
MDE1P47095 DDR2YOL052C-A 186 nt10□□□□□ -0.81
MDE1P47095 SPP1YPL138C 1062 nt10□□□□□ -0.81
MDE1P47095 PBP1YGR178C 2169 nt9.98□□□□□ -0.81
MDE1P47095 GAL1YBR020W 1587 nt9.98□□□□□ -0.81
MDE1P47095 TIM23YNR017W 669 nt9.97□□□□□ -0.81
MDE1P47095 ATF2YGR177C 1608 nt9.96□□□□□ -0.81
MDE1P47095 TRM5YHR070W 1500 nt9.96□□□□□ -0.82
MDE1P47095 YLR179CYLR179C 606 nt9.95□□□□□ -0.82
MDE1P47095 SSN3YPL042C 1668 nt9.95□□□□□ -0.82
MDE1P47095 FUR4YBR021W 1902 nt9.95□□□□□ -0.82
MDE1P47095 YKL030WYKL030W 606 nt9.94□□□□□ -0.82
MDE1P47095 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.93□□□□□ -0.82
MDE1P47095 AAC1YMR056C 930 nt9.93□□□□□ -0.82
MDE1P47095 BIO5YNR056C 1686 nt9.92□□□□□ -0.82
MDE1P47095 CMP2YML057W 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
MDE1P47095 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.91□□□□□ -0.82
MDE1P47095 SNG1YGR197C 1644 nt9.91□□□□□ -0.82
MDE1P47095 RAX1YOR301W 1308 nt9.9□□□□□ -0.82
MDE1P47095 BNA2YJR078W 1362 nt9.88□□□□□ -0.83
MDE1P47095 MIC10YCL057C-A 294 nt9.88□□□□□ -0.83
MDE1P47095 PRP4YPR178W 1398 nt9.88□□□□□ -0.83
MDE1P47095 CYT2YKL087C 675 nt9.87□□□□□ -0.83
MDE1P47095 STB1YNL309W 1263 nt9.87□□□□□ -0.83
MDE1P47095 GPI16YHR188C 1833 nt9.86□□□□□ -0.83
MDE1P47095 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.86□□□□□ -0.83
MDE1P47095 YPR064WYPR064W 420 nt9.86□□□□□ -0.83
MDE1P47095 DPS1YLL018C 1674 nt9.85□□□□□ -0.83
MDE1P47095 SPC25YER018C 666 nt9.84□□□□□ -0.83
MDE1P47095 BSP1YPR171W 1731 nt9.84□□□□□ -0.83
MDE1P47095 ANP1YEL036C 1503 nt9.83□□□□□ -0.84
MDE1P47095 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.83□□□□□ -0.84
MDE1P47095 YEL076CYEL076C 651 nt9.83□□□□□ -0.84
MDE1P47095 YLR464WYLR464W 651 nt9.83□□□□□ -0.84
MDE1P47095 SNF1YDR477W 1902 nt9.82□□□□□ -0.84
MDE1P47095 FEN2YCR028C 1539 nt9.79□□□□□ -0.84
MDE1P47095 AHT1YHR093W 549 nt9.79□□□□□ -0.84
MDE1P47095 SWC5YBR231C 912 nt9.78□□□□□ -0.84
MDE1P47095 HEL2YDR266C 1920 nt9.78□□□□□ -0.84
MDE1P47095 CCT4YDL143W 1587 nt9.77□□□□□ -0.85
MDE1P47095 WSC2YNL283C 1512 nt9.75□□□□□ -0.85
MDE1P47095 TAD3YLR316C 969 nt9.74□□□□□ -0.85
MDE1P47095 RTG1YOL067C 534 nt9.74□□□□□ -0.85
MDE1P47095 VPS60YDR486C 690 nt9.73□□□□□ -0.85
MDE1P47095 HUA1YGR268C 597 nt9.73□□□□□ -0.85
MDE1P47095 CCA1YER168C 1641 nt9.71□□□□□ -0.85
MDE1P47095 MIC12YBR262C 321 nt9.71□□□□□ -0.86
MDE1P47095 YIR016WYIR016W 798 nt9.7□□□□□ -0.86
MDE1P47095 MRPL8YJL063C 717 nt9.7□□□□□ -0.86
MDE1P47095 ADO1YJR105W 1023 nt9.69□□□□□ -0.86
MDE1P47095 HHO1YPL127C 777 nt9.69□□□□□ -0.86
MDE1P47095 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.68□□□□□ -0.86
MDE1P47095 YAT1YAR035W 2064 nt9.67□□□□□ -0.86
MDE1P47095 YGR201CYGR201C 678 nt9.65□□□□□ -0.86
MDE1P47095 ALG3YBL082C 1377 nt9.63□□□□□ -0.87
MDE1P47095 YLR415CYLR415C 339 nt9.63□□□□□ -0.87
MDE1P47095 DUS1YML080W 1272 nt9.62□□□□□ -0.87
MDE1P47095 YKR005CYKR005C 1578 nt9.6□□□□□ -0.87
MDE1P47095 BMT6YLR063W 1098 nt9.6□□□□□ -0.87
MDE1P47095 NDI1YML120C 1542 nt9.56□□□□□ -0.88
MDE1P47095 XDJ1YLR090W 1380 nt9.54□□□□□ -0.88
MDE1P47095 YCL074WYCL074W 927 nt9.54□□□□□ -0.88
MDE1P47095 BDH1YAL060W 1149 nt9.54□□□□□ -0.88
MDE1P47095 TIM17YJL143W 477 nt9.53□□□□□ -0.88
MDE1P47095 GOR1YNL274C 1053 nt9.53□□□□□ -0.88
MDE1P47095 AGP1YCL025C 1902 nt9.51□□□□□ -0.89
MDE1P47095 UBX6YJL048C 1191 nt9.51□□□□□ -0.89
MDE1P47095 GDH3YAL062W 1374 nt9.5□□□□□ -0.89
MDE1P47095 AVT6YER119C 1347 nt9.5□□□□□ -0.89
MDE1P47095 GID7YCL039W 2238 nt9.5□□□□□ -0.89
MDE1P47095 IRC24YIR036C 792 nt9.49□□□□□ -0.89
MDE1P47095 SFP1YLR403W 2052 nt9.46□□□□□ -0.89
MDE1P47095 ESBP6YNL125C 2022 nt9.45□□□□□ -0.9
MDE1P47095 SHM2YLR058C 1410 nt9.45□□□□□ -0.9
MDE1P47095 YSP3YOR003W 1437 nt9.45□□□□□ -0.9
MDE1P47095 SPT20YOL148C 1815 nt9.45□□□□□ -0.9
MDE1P47095 RIM8YGL045W 1629 nt9.44□□□□□ -0.9
MDE1P47095 PEX25YPL112C 1185 nt9.41□□□□□ -0.9
MDE1P47095 MAE1YKL029C 2010 nt9.4□□□□□ -0.9
MDE1P47095 YGR259CYGR259C 441 nt9.4□□□□□ -0.9
MDE1P47095 YNL115CYNL115C 1935 nt9.39□□□□□ -0.91
MDE1P47095 AQY2YLL052C 450 nt9.39□□□□□ -0.91
MDE1P47095 YGL114WYGL114W 2178 nt9.38□□□□□ -0.91
MDE1P47095 STR3YGL184C 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
MDE1P47095 MET2YNL277W 1461 nt9.37□□□□□ -0.91
MDE1P47095 VPS75YNL246W 795 nt9.36□□□□□ -0.91
MDE1P47095 DAT1YML113W 747 nt9.35□□□□□ -0.91
MDE1P47095 RPC82YPR190C 1965 nt9.35□□□□□ -0.91
MDE1P47095 DUT1YBR252W 444 nt9.34□□□□□ -0.91
MDE1P47095 RFC1YOR217W 2586 nt9.34□□□□□ -0.91
MDE1P47095 YCR102CYCR102C 1107 nt9.33□□□□□ -0.92
MDE1P47095 YFR018CYFR018C 1092 nt9.33□□□□□ -0.92
MDE1P47095 NPP1YCR026C 2229 nt9.33□□□□□ -0.92
MDE1P47095 RTN2YDL204W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
MDE1P47095 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.31□□□□□ -0.92
MDE1P47095 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.31□□□□□ -0.92
MDE1P47095 HMG2YLR450W 3138 nt9.31□□□□□ -0.92
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