Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL35P42766 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL35P42766 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL35P42766 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL35P42766 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL35P42766 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL35P42766 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL35P42766 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL35P42766 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL35P42766 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL35P42766 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL35P42766 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL35P42766 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL35P42766 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL35P42766 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL35P42766 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL35P42766 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL35P42766 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL35P42766 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL35P42766 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL35P42766 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL35P42766 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL35P42766 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL35P42766 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL35P42766 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL35P42766 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL35P42766 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL35P42766 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL35P42766 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL35P42766 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL35P42766 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL35P42766 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL35P42766 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL35P42766 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL35P42766 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL35P42766 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL35P42766 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL35P42766 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL35P42766 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL35P42766 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL35P42766 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL35P42766 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL35P42766 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL35P42766 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL35P42766 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL35P42766 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL35P42766 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL35P42766 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL35P42766 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL35P42766 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL35P42766 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL35P42766 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL35P42766 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL35P42766 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL35P42766 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL35P42766 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL35P42766 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL35P42766 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL35P42766 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL35P42766 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL35P42766 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL35P42766 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL35P42766 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL35P42766 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL35P42766 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL35P42766 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL35P42766 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL35P42766 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL35P42766 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL35P42766 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL35P42766 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL35P42766 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL35P42766 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL35P42766 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL35P42766 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL35P42766 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL35P42766 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL35P42766 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL35P42766 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL35P42766 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL35P42766 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL35P42766 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL35P42766 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL35P42766 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL35P42766 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL35P42766 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms