Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECI1P42126 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECI1P42126 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECI1P42126 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECI1P42126 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECI1P42126 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECI1P42126 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECI1P42126 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECI1P42126 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECI1P42126 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECI1P42126 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECI1P42126 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECI1P42126 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECI1P42126 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECI1P42126 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECI1P42126 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECI1P42126 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECI1P42126 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECI1P42126 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECI1P42126 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECI1P42126 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECI1P42126 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECI1P42126 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECI1P42126 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECI1P42126 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECI1P42126 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECI1P42126 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECI1P42126 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECI1P42126 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECI1P42126 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECI1P42126 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECI1P42126 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECI1P42126 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECI1P42126 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECI1P42126 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECI1P42126 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECI1P42126 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECI1P42126 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECI1P42126 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECI1P42126 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECI1P42126 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECI1P42126 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECI1P42126 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECI1P42126 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECI1P42126 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECI1P42126 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECI1P42126 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECI1P42126 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECI1P42126 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECI1P42126 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECI1P42126 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECI1P42126 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECI1P42126 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECI1P42126 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECI1P42126 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECI1P42126 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECI1P42126 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECI1P42126 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECI1P42126 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ECI1P42126 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECI1P42126 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECI1P42126 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECI1P42126 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECI1P42126 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECI1P42126 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECI1P42126 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECI1P42126 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECI1P42126 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECI1P42126 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECI1P42126 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECI1P42126 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECI1P42126 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECI1P42126 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECI1P42126 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECI1P42126 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECI1P42126 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECI1P42126 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECI1P42126 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECI1P42126 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECI1P42126 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECI1P42126 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECI1P42126 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECI1P42126 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECI1P42126 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECI1P42126 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECI1P42126 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECI1P42126 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECI1P42126 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECI1P42126 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECI1P42126 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECI1P42126 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECI1P42126 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECI1P42126 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECI1P42126 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECI1P42126 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECI1P42126 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECI1P42126 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECI1P42126 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECI1P42126 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECI1P42126 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms