Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 TRM5YHR070W 1500 nt9.98□□□□□ -0.81
DDI1P40087 MOT3YMR070W 1473 nt9.97□□□□□ -0.81
DDI1P40087 GAL1YBR020W 1587 nt9.97□□□□□ -0.81
DDI1P40087 FRD1YEL047C 1413 nt9.96□□□□□ -0.82
DDI1P40087 YKR005CYKR005C 1578 nt9.96□□□□□ -0.82
DDI1P40087 YKR040CYKR040C 504 nt9.95□□□□□ -0.82
DDI1P40087 HSL7YBR133C 2484 nt9.94□□□□□ -0.82
DDI1P40087 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.94□□□□□ -0.82
DDI1P40087 DUS1YML080W 1272 nt9.94□□□□□ -0.82
DDI1P40087 WSC2YNL283C 1512 nt9.92□□□□□ -0.82
DDI1P40087 ERV46YAL042W 1248 nt9.92□□□□□ -0.82
DDI1P40087 DIC1YLR348C 897 nt9.92□□□□□ -0.82
DDI1P40087 YPR011CYPR011C 981 nt9.9□□□□□ -0.82
DDI1P40087 YCL074WYCL074W 927 nt9.89□□□□□ -0.83
DDI1P40087 LPX1YOR084W 1164 nt9.89□□□□□ -0.83
DDI1P40087 ANP1YEL036C 1503 nt9.87□□□□□ -0.83
DDI1P40087 BIO5YNR056C 1686 nt9.87□□□□□ -0.83
DDI1P40087 YGR259CYGR259C 441 nt9.87□□□□□ -0.83
DDI1P40087 AQY1YPR192W 918 nt9.86□□□□□ -0.83
DDI1P40087 CMP2YML057W 1815 nt9.86□□□□□ -0.83
DDI1P40087 SNF1YDR477W 1902 nt9.85□□□□□ -0.83
DDI1P40087 MIC12YBR262C 321 nt9.84□□□□□ -0.83
DDI1P40087 IRC24YIR036C 792 nt9.83□□□□□ -0.84
DDI1P40087 HHO1YPL127C 777 nt9.83□□□□□ -0.84
DDI1P40087 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.82□□□□□ -0.84
DDI1P40087 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.82□□□□□ -0.84
DDI1P40087 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.82□□□□□ -0.84
DDI1P40087 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.82□□□□□ -0.84
DDI1P40087 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.82□□□□□ -0.84
DDI1P40087 AGP1YCL025C 1902 nt9.82□□□□□ -0.84
DDI1P40087 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.81□□□□□ -0.84
DDI1P40087 STB1YNL309W 1263 nt9.8□□□□□ -0.84
DDI1P40087 CYT2YKL087C 675 nt9.79□□□□□ -0.84
DDI1P40087 FEN2YCR028C 1539 nt9.78□□□□□ -0.84
DDI1P40087 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.78□□□□□ -0.84
DDI1P40087 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.78□□□□□ -0.84
DDI1P40087 PBP1YGR178C 2169 nt9.78□□□□□ -0.84
DDI1P40087 SPC25YER018C 666 nt9.76□□□□□ -0.85
DDI1P40087 GPI16YHR188C 1833 nt9.76□□□□□ -0.85
DDI1P40087 YIR016WYIR016W 798 nt9.71□□□□□ -0.86
DDI1P40087 HEL2YDR266C 1920 nt9.71□□□□□ -0.86
DDI1P40087 YGR201CYGR201C 678 nt9.7□□□□□ -0.86
DDI1P40087 YLR179CYLR179C 606 nt9.7□□□□□ -0.86
DDI1P40087 TIM23YNR017W 669 nt9.69□□□□□ -0.86
DDI1P40087 VPS60YDR486C 690 nt9.67□□□□□ -0.86
DDI1P40087 PTH1YHR189W 573 nt9.67□□□□□ -0.86
DDI1P40087 YLR235CYLR235C 399 nt9.67□□□□□ -0.86
DDI1P40087 STR3YGL184C 1398 nt9.65□□□□□ -0.86
DDI1P40087 CCT4YDL143W 1587 nt9.65□□□□□ -0.86
DDI1P40087 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.65□□□□□ -0.86
DDI1P40087 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.65□□□□□ -0.86
DDI1P40087 SWC5YBR231C 912 nt9.64□□□□□ -0.87
DDI1P40087 XDJ1YLR090W 1380 nt9.63□□□□□ -0.87
DDI1P40087 AQY2YLL052C 450 nt9.62□□□□□ -0.87
DDI1P40087 GOR1YNL274C 1053 nt9.6□□□□□ -0.87
DDI1P40087 ALG3YBL082C 1377 nt9.59□□□□□ -0.87
DDI1P40087 DUT1YBR252W 444 nt9.57□□□□□ -0.88
DDI1P40087 AVT6YER119C 1347 nt9.56□□□□□ -0.88
DDI1P40087 RTN2YDL204W 1182 nt9.56□□□□□ -0.88
DDI1P40087 AHT1YHR093W 549 nt9.56□□□□□ -0.88
DDI1P40087 RPM1RPM1 483 nt9.55□□□□□ -0.88
DDI1P40087 YPR064WYPR064W 420 nt9.53□□□□□ -0.88
DDI1P40087 GDH3YAL062W 1374 nt9.51□□□□□ -0.89
DDI1P40087 NDI1YML120C 1542 nt9.51□□□□□ -0.89
DDI1P40087 YAT1YAR035W 2064 nt9.5□□□□□ -0.89
DDI1P40087 YKL030WYKL030W 606 nt9.48□□□□□ -0.89
DDI1P40087 SPP1YPL138C 1062 nt9.45□□□□□ -0.9
DDI1P40087 MET2YNL277W 1461 nt9.42□□□□□ -0.9
DDI1P40087 TAD3YLR316C 969 nt9.42□□□□□ -0.9
DDI1P40087 SFP1YLR403W 2052 nt9.41□□□□□ -0.9
DDI1P40087 SPT20YOL148C 1815 nt9.38□□□□□ -0.91
DDI1P40087 INA1YLR413W 2028 nt9.38□□□□□ -0.91
DDI1P40087 SHM2YLR058C 1410 nt9.35□□□□□ -0.91
DDI1P40087 ALD4YOR374W 1560 nt9.35□□□□□ -0.91
DDI1P40087 RIM8YGL045W 1629 nt9.34□□□□□ -0.91
DDI1P40087 PLB1YMR008C 1995 nt9.34□□□□□ -0.91
DDI1P40087 HIF1YLL022C 1158 nt9.34□□□□□ -0.91
DDI1P40087 TIM17YJL143W 477 nt9.33□□□□□ -0.92
DDI1P40087 YLR415CYLR415C 339 nt9.33□□□□□ -0.92
DDI1P40087 MAE1YKL029C 2010 nt9.32□□□□□ -0.92
DDI1P40087 PRM5YIL117C 957 nt9.29□□□□□ -0.92
DDI1P40087 DAT1YML113W 747 nt9.29□□□□□ -0.92
DDI1P40087 YCR102CYCR102C 1107 nt9.28□□□□□ -0.92
DDI1P40087 BDH1YAL060W 1149 nt9.28□□□□□ -0.92
DDI1P40087 RPC82YPR190C 1965 nt9.28□□□□□ -0.92
DDI1P40087 ARP6YLR085C 1317 nt9.28□□□□□ -0.92
DDI1P40087 NPP1YCR026C 2229 nt9.27□□□□□ -0.93
DDI1P40087 YGL114WYGL114W 2178 nt9.26□□□□□ -0.93
DDI1P40087 NBP35YGL091C 987 nt9.26□□□□□ -0.93
DDI1P40087 SAM35YHR083W 990 nt9.21□□□□□ -0.94
DDI1P40087 NIT1YIL164C 600 nt9.21□□□□□ -0.94
DDI1P40087 ZRT3YKL175W 1512 nt9.2□□□□□ -0.94
DDI1P40087 HMG2YLR450W 3138 nt9.19□□□□□ -0.94
DDI1P40087 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.18□□□□□ -0.94
DDI1P40087 UTR1YJR049C 1593 nt9.18□□□□□ -0.94
DDI1P40087 TPO4YOR273C 1980 nt9.17□□□□□ -0.94
DDI1P40087 SGT2YOR007C 1041 nt9.17□□□□□ -0.94
DDI1P40087 YSP3YOR003W 1437 nt9.13□□□□□ -0.95
DDI1P40087 GAP1YKR039W 1809 nt9.12□□□□□ -0.95
DDI1P40087 ACO2YJL200C 2370 nt9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms