Protein–RNA interactions for Protein: P38759

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, yeastyeast

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS29P38759 EMI2YDR516C 1503 nt12.81□□□□□ -0.36
VPS29P38759 IRC15YPL017C 1500 nt12.81□□□□□ -0.36
VPS29P38759 SOR2YDL246C 1074 nt12.8□□□□□ -0.36
VPS29P38759 SOR1YJR159W 1074 nt12.8□□□□□ -0.36
VPS29P38759 LCB1YMR296C 1677 nt12.79□□□□□ -0.36
VPS29P38759 YJL107CYJL107C 1164 nt12.78□□□□□ -0.36
VPS29P38759 CUE1YMR264W 612 nt12.78□□□□□ -0.36
VPS29P38759 NEM1YHR004C 1341 nt12.78□□□□□ -0.36
VPS29P38759 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.77□□□□□ -0.37
VPS29P38759 YDL221WYDL221W 552 nt12.75□□□□□ -0.37
VPS29P38759 CWP1YKL096W 720 nt12.72□□□□□ -0.37
VPS29P38759 GIS3YLR094C 1509 nt12.72□□□□□ -0.37
VPS29P38759 RSM23YGL129C 1353 nt12.69□□□□□ -0.38
VPS29P38759 FTR1YER145C 1215 nt12.68□□□□□ -0.38
VPS29P38759 YMR090WYMR090W 684 nt12.68□□□□□ -0.38
VPS29P38759 FMP52YER004W 696 nt12.67□□□□□ -0.38
VPS29P38759 ADH2YMR303C 1047 nt12.67□□□□□ -0.38
VPS29P38759 THP3YPR045C 1413 nt12.67□□□□□ -0.38
VPS29P38759 STD1YOR047C 1335 nt12.66□□□□□ -0.38
VPS29P38759 YIL100WYIL100W 354 nt12.66□□□□□ -0.38
VPS29P38759 YEL074WYEL074W 339 nt12.62□□□□□ -0.39
VPS29P38759 LSM12YHR121W 564 nt12.62□□□□□ -0.39
VPS29P38759 YHL044WYHL044W 708 nt12.6□□□□□ -0.39
VPS29P38759 AST1YBL069W 1290 nt12.6□□□□□ -0.39
VPS29P38759 TIM23YNR017W 669 nt12.6□□□□□ -0.39
VPS29P38759 PEX27YOR193W 1131 nt12.59□□□□□ -0.39
VPS29P38759 PAU16YKL224C 372 nt12.56□□□□□ -0.4
VPS29P38759 DIC1YLR348C 897 nt12.56□□□□□ -0.4
VPS29P38759 PHO92YDR374C 921 nt12.55□□□□□ -0.4
VPS29P38759 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.55□□□□□ -0.4
VPS29P38759 YFR018CYFR018C 1092 nt12.52□□□□□ -0.41
VPS29P38759 YLR179CYLR179C 606 nt12.52□□□□□ -0.41
VPS29P38759 SCC4YER147C 1875 nt12.52□□□□□ -0.41
VPS29P38759 PCM1YEL058W 1674 nt12.51□□□□□ -0.41
VPS29P38759 SNF6YHL025W 999 nt12.51□□□□□ -0.41
VPS29P38759 YLR036CYLR036C 612 nt12.5□□□□□ -0.41
VPS29P38759 SDH1YKL148C 1923 nt12.5□□□□□ -0.41
VPS29P38759 RRT5YFR032C 870 nt12.49□□□□□ -0.41
VPS29P38759 SBA1YKL117W 651 nt12.49□□□□□ -0.41
VPS29P38759 PRE6YOL038W 765 nt12.49□□□□□ -0.41
VPS29P38759 YPR064WYPR064W 420 nt12.47□□□□□ -0.41
VPS29P38759 MPS2YGL075C 1164 nt12.46□□□□□ -0.41
VPS29P38759 MOD5YOR274W 1287 nt12.46□□□□□ -0.41
VPS29P38759 YGL118CYGL118C 438 nt12.45□□□□□ -0.42
VPS29P38759 MPC1YGL080W 393 nt12.42□□□□□ -0.42
VPS29P38759 RNQ1YCL028W 1218 nt12.42□□□□□ -0.42
VPS29P38759 STB1YNL309W 1263 nt12.41□□□□□ -0.42
VPS29P38759 YHP1YDR451C 1062 nt12.4□□□□□ -0.42
VPS29P38759 TAD3YLR316C 969 nt12.4□□□□□ -0.42
VPS29P38759 YBR220CYBR220C 1683 nt12.4□□□□□ -0.42
VPS29P38759 YML079WYML079W 606 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS29P38759 YIH1YCR059C 777 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS29P38759 UBC12YLR306W 567 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS29P38759 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS29P38759 YPL041CYPL041C 624 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS29P38759 WSC2YNL283C 1512 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS29P38759 GTT3YEL017W 1014 nt12.35□□□□□ -0.43
VPS29P38759 PIC2YER053C 903 nt12.35□□□□□ -0.43
VPS29P38759 FAR3YMR052W 615 nt12.35□□□□□ -0.43
VPS29P38759 COG1YGL223C 1254 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS29P38759 AHT1YHR093W 549 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS29P38759 YJR154WYJR154W 1041 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS29P38759 ARC19YKL013C 516 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS29P38759 SSA4YER103W 1929 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS29P38759 FTH1YBR207W 1398 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS29P38759 YFL066CYFL066C 1179 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS29P38759 YNL195CYNL195C 786 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS29P38759 COX3Q0275 810 nt12.32□□□□□ -0.44
VPS29P38759 YBL081WYBL081W 1107 nt12.32□□□□□ -0.44
VPS29P38759 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt12.3□□□□□ -0.44
VPS29P38759 YLL053CYLL053C 459 nt12.27□□□□□ -0.45
VPS29P38759 RRT12YCR045C 1476 nt12.26□□□□□ -0.45
VPS29P38759 PAB1YER165W 1734 nt12.25□□□□□ -0.45
VPS29P38759 YNL234WYNL234W 1281 nt12.23□□□□□ -0.45
VPS29P38759 PEX25YPL112C 1185 nt12.23□□□□□ -0.45
VPS29P38759 YSC84YHR016C 1407 nt12.22□□□□□ -0.45
VPS29P38759 SED5YLR026C 1023 nt12.22□□□□□ -0.45
VPS29P38759 BIO4YNR057C 714 nt12.21□□□□□ -0.45
VPS29P38759 BNA3YJL060W 1335 nt12.2□□□□□ -0.46
VPS29P38759 NAT5YOR253W 531 nt12.2□□□□□ -0.46
VPS29P38759 BNS1YGR230W 414 nt12.19□□□□□ -0.46
VPS29P38759 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.19□□□□□ -0.46
VPS29P38759 SIM1YIL123W 1431 nt12.19□□□□□ -0.46
VPS29P38759 GAL1YBR020W 1587 nt12.18□□□□□ -0.46
VPS29P38759 ARP6YLR085C 1317 nt12.18□□□□□ -0.46
VPS29P38759 NAT4YMR069W 858 nt12.18□□□□□ -0.46
VPS29P38759 AQY1YPR192W 918 nt12.18□□□□□ -0.46
VPS29P38759 BDH1YAL060W 1149 nt12.17□□□□□ -0.46
VPS29P38759 MRPL36YBR122C 534 nt12.17□□□□□ -0.46
VPS29P38759 YNL115CYNL115C 1935 nt12.17□□□□□ -0.46
VPS29P38759 HOS2YGL194C 1359 nt12.17□□□□□ -0.46
VPS29P38759 YSP3YOR003W 1437 nt12.16□□□□□ -0.46
VPS29P38759 AIM41YOR215C 558 nt12.15□□□□□ -0.46
VPS29P38759 TRM5YHR070W 1500 nt12.15□□□□□ -0.46
VPS29P38759 ICE2YIL090W 1476 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS29P38759 YPR1YDR368W 939 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS29P38759 NEJ1YLR265C 1029 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS29P38759 RUF21RUF21 707 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS29P38759 VPS28YPL065W 729 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS29P38759 GLK1YCL040W 1503 nt12.12□□□□□ -0.47
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