Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeastyeast

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC110P32380 TRM5YHR070W 1500 nt11.97□□□□□ -0.49
SPC110P32380 GAL1YBR020W 1587 nt11.96□□□□□ -0.49
SPC110P32380 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.93□□□□□ -0.5
SPC110P32380 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.93□□□□□ -0.5
SPC110P32380 CCA1YER168C 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
SPC110P32380 FUR4YBR021W 1902 nt11.92□□□□□ -0.5
SPC110P32380 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.91□□□□□ -0.5
SPC110P32380 BNA2YJR078W 1362 nt11.9□□□□□ -0.5
SPC110P32380 SPP1YPL138C 1062 nt11.88□□□□□ -0.51
SPC110P32380 AQY1YPR192W 918 nt11.88□□□□□ -0.51
SPC110P32380 HSL7YBR133C 2484 nt11.83□□□□□ -0.52
SPC110P32380 PTH1YHR189W 573 nt11.83□□□□□ -0.52
SPC110P32380 ANP1YEL036C 1503 nt11.82□□□□□ -0.52
SPC110P32380 YLR235CYLR235C 399 nt11.81□□□□□ -0.52
SPC110P32380 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.8□□□□□ -0.52
SPC110P32380 STB1YNL309W 1263 nt11.8□□□□□ -0.52
SPC110P32380 PRP4YPR178W 1398 nt11.79□□□□□ -0.52
SPC110P32380 TIM23YNR017W 669 nt11.78□□□□□ -0.52
SPC110P32380 YLR179CYLR179C 606 nt11.77□□□□□ -0.53
SPC110P32380 CMP2YML057W 1815 nt11.75□□□□□ -0.53
SPC110P32380 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.75□□□□□ -0.53
SPC110P32380 YEL076CYEL076C 651 nt11.75□□□□□ -0.53
SPC110P32380 SPC25YER018C 666 nt11.75□□□□□ -0.53
SPC110P32380 YLR464WYLR464W 651 nt11.75□□□□□ -0.53
SPC110P32380 FEN2YCR028C 1539 nt11.75□□□□□ -0.53
SPC110P32380 GPI16YHR188C 1833 nt11.74□□□□□ -0.53
SPC110P32380 DUS1YML080W 1272 nt11.74□□□□□ -0.53
SPC110P32380 BMT6YLR063W 1098 nt11.73□□□□□ -0.53
SPC110P32380 MIC12YBR262C 321 nt11.73□□□□□ -0.53
SPC110P32380 AAC1YMR056C 930 nt11.71□□□□□ -0.53
SPC110P32380 HHO1YPL127C 777 nt11.71□□□□□ -0.53
SPC110P32380 RPM1RPM1 483 nt11.7□□□□□ -0.54
SPC110P32380 DPS1YLL018C 1674 nt11.69□□□□□ -0.54
SPC110P32380 MRPL8YJL063C 717 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC110P32380 RTG1YOL067C 534 nt11.67□□□□□ -0.54
SPC110P32380 WSC2YNL283C 1512 nt11.66□□□□□ -0.54
SPC110P32380 YCL074WYCL074W 927 nt11.65□□□□□ -0.54
SPC110P32380 VPS60YDR486C 690 nt11.65□□□□□ -0.54
SPC110P32380 YIR016WYIR016W 798 nt11.65□□□□□ -0.54
SPC110P32380 CCT4YDL143W 1587 nt11.64□□□□□ -0.55
SPC110P32380 YKR005CYKR005C 1578 nt11.64□□□□□ -0.55
SPC110P32380 HEL2YDR266C 1920 nt11.64□□□□□ -0.55
SPC110P32380 AGP1YCL025C 1902 nt11.63□□□□□ -0.55
SPC110P32380 YKL030WYKL030W 606 nt11.63□□□□□ -0.55
SPC110P32380 SWC5YBR231C 912 nt11.63□□□□□ -0.55
SPC110P32380 AHT1YHR093W 549 nt11.6□□□□□ -0.55
SPC110P32380 ADO1YJR105W 1023 nt11.59□□□□□ -0.55
SPC110P32380 YPR064WYPR064W 420 nt11.59□□□□□ -0.55
SPC110P32380 YGR201CYGR201C 678 nt11.58□□□□□ -0.56
SPC110P32380 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.58□□□□□ -0.56
SPC110P32380 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.58□□□□□ -0.56
SPC110P32380 YGR259CYGR259C 441 nt11.57□□□□□ -0.56
SPC110P32380 PBP1YGR178C 2169 nt11.56□□□□□ -0.56
SPC110P32380 ALG3YBL082C 1377 nt11.55□□□□□ -0.56
SPC110P32380 CYT2YKL087C 675 nt11.54□□□□□ -0.56
SPC110P32380 BIO5YNR056C 1686 nt11.49□□□□□ -0.57
SPC110P32380 HUA1YGR268C 597 nt11.49□□□□□ -0.57
SPC110P32380 TAD3YLR316C 969 nt11.48□□□□□ -0.57
SPC110P32380 XDJ1YLR090W 1380 nt11.47□□□□□ -0.57
SPC110P32380 IRC24YIR036C 792 nt11.47□□□□□ -0.57
SPC110P32380 GOR1YNL274C 1053 nt11.46□□□□□ -0.57
SPC110P32380 AVT6YER119C 1347 nt11.45□□□□□ -0.58
SPC110P32380 SNF1YDR477W 1902 nt11.45□□□□□ -0.58
SPC110P32380 STR3YGL184C 1398 nt11.43□□□□□ -0.58
SPC110P32380 AQY2YLL052C 450 nt11.43□□□□□ -0.58
SPC110P32380 GDH3YAL062W 1374 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC110P32380 DUT1YBR252W 444 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC110P32380 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.4□□□□□ -0.58
SPC110P32380 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.4□□□□□ -0.58
SPC110P32380 YLR415CYLR415C 339 nt11.35□□□□□ -0.59
SPC110P32380 MET2YNL277W 1461 nt11.35□□□□□ -0.59
SPC110P32380 YAT1YAR035W 2064 nt11.34□□□□□ -0.59
SPC110P32380 SFP1YLR403W 2052 nt11.32□□□□□ -0.6
SPC110P32380 RTN2YDL204W 1182 nt11.31□□□□□ -0.6
SPC110P32380 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.31□□□□□ -0.6
SPC110P32380 BDH1YAL060W 1149 nt11.3□□□□□ -0.6
SPC110P32380 SHM2YLR058C 1410 nt11.28□□□□□ -0.6
SPC110P32380 TIM17YJL143W 477 nt11.28□□□□□ -0.6
SPC110P32380 NDI1YML120C 1542 nt11.24□□□□□ -0.61
SPC110P32380 NPP1YCR026C 2229 nt11.2□□□□□ -0.62
SPC110P32380 RIM8YGL045W 1629 nt11.17□□□□□ -0.62
SPC110P32380 DAT1YML113W 747 nt11.16□□□□□ -0.62
SPC110P32380 YDR094WYDR094W 336 nt11.15□□□□□ -0.62
SPC110P32380 YSP3YOR003W 1437 nt11.15□□□□□ -0.62
SPC110P32380 YCR102CYCR102C 1107 nt11.14□□□□□ -0.63
SPC110P32380 MAE1YKL029C 2010 nt11.14□□□□□ -0.63
SPC110P32380 NIT1YIL164C 600 nt11.12□□□□□ -0.63
SPC110P32380 UBX6YJL048C 1191 nt11.09□□□□□ -0.63
SPC110P32380 SGT2YOR007C 1041 nt11.09□□□□□ -0.63
SPC110P32380 NBP35YGL091C 987 nt11.08□□□□□ -0.64
SPC110P32380 PLB1YMR008C 1995 nt11.08□□□□□ -0.64
SPC110P32380 YFR018CYFR018C 1092 nt11.07□□□□□ -0.64
SPC110P32380 YNL115CYNL115C 1935 nt11.05□□□□□ -0.64
SPC110P32380 ARP6YLR085C 1317 nt11.05□□□□□ -0.64
SPC110P32380 SPT20YOL148C 1815 nt11.04□□□□□ -0.64
SPC110P32380 GID7YCL039W 2238 nt11.03□□□□□ -0.64
SPC110P32380 PEX25YPL112C 1185 nt11.01□□□□□ -0.65
SPC110P32380 YGL114WYGL114W 2178 nt11.01□□□□□ -0.65
SPC110P32380 HMG2YLR450W 3138 nt11□□□□□ -0.65
SPC110P32380 ALD4YOR374W 1560 nt11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms