Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGOLN2O43493 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGOLN2O43493 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGOLN2O43493 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGOLN2O43493 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGOLN2O43493 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGOLN2O43493 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TGOLN2O43493 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGOLN2O43493 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGOLN2O43493 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGOLN2O43493 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGOLN2O43493 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGOLN2O43493 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms