Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSO14618 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSO14618 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSO14618 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSO14618 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSO14618 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSO14618 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSO14618 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSO14618 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSO14618 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSO14618 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSO14618 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCSO14618 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSO14618 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSO14618 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSO14618 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSO14618 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSO14618 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSO14618 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSO14618 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSO14618 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSO14618 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSO14618 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSO14618 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCSO14618 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSO14618 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSO14618 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSO14618 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSO14618 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSO14618 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSO14618 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSO14618 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSO14618 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSO14618 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSO14618 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSO14618 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSO14618 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSO14618 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSO14618 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSO14618 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSO14618 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSO14618 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSO14618 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSO14618 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSO14618 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSO14618 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSO14618 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSO14618 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSO14618 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSO14618 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSO14618 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSO14618 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSO14618 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSO14618 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSO14618 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSO14618 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSO14618 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSO14618 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSO14618 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSO14618 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSO14618 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSO14618 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCSO14618 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSO14618 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSO14618 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSO14618 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSO14618 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSO14618 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSO14618 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSO14618 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSO14618 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSO14618 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSO14618 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSO14618 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSO14618 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSO14618 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSO14618 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSO14618 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSO14618 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSO14618 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSO14618 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSO14618 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSO14618 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSO14618 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSO14618 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSO14618 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSO14618 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSO14618 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSO14618 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSO14618 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSO14618 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSO14618 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSO14618 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSO14618 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms