Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP27XA6NNY8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP27XA6NNY8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP27XA6NNY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP27XA6NNY8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP27XA6NNY8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP27XA6NNY8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP27XA6NNY8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP27XA6NNY8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP27XA6NNY8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP27XA6NNY8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP27XA6NNY8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP27XA6NNY8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP27XA6NNY8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP27XA6NNY8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP27XA6NNY8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
USP27XA6NNY8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP27XA6NNY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP27XA6NNY8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP27XA6NNY8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP27XA6NNY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP27XA6NNY8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.37
USP27XA6NNY8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP27XA6NNY8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP27XA6NNY8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP27XA6NNY8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms