Protein–RNA interactions for Protein: A6NKN8

PCP4L1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4L1A6NKN8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCP4L1A6NKN8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCP4L1A6NKN8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCP4L1A6NKN8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCP4L1A6NKN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4L1A6NKN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCP4L1A6NKN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCP4L1A6NKN8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCP4L1A6NKN8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms