Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGPEP1LA6NFU8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGPEP1LA6NFU8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGPEP1LA6NFU8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGPEP1LA6NFU8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGPEP1LA6NFU8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGPEP1LA6NFU8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGPEP1LA6NFU8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGPEP1LA6NFU8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGPEP1LA6NFU8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGPEP1LA6NFU8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGPEP1LA6NFU8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGPEP1LA6NFU8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGPEP1LA6NFU8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGPEP1LA6NFU8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGPEP1LA6NFU8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGPEP1LA6NFU8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGPEP1LA6NFU8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms