Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS05

TRBV5-7, T-cell receptor beta variable 5-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-7A0A0A0MS05 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV5-7A0A0A0MS05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-7A0A0A0MS05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV5-7A0A0A0MS05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV5-7A0A0A0MS05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV5-7A0A0A0MS05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV5-7A0A0A0MS05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-7A0A0A0MS05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-7A0A0A0MS05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV5-7A0A0A0MS05 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV5-7A0A0A0MS05 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-7A0A0A0MS05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV5-7A0A0A0MS05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV5-7A0A0A0MS05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-7A0A0A0MS05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV5-7A0A0A0MS05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV5-7A0A0A0MS05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV5-7A0A0A0MS05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-7A0A0A0MS05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRBV5-7A0A0A0MS05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV5-7A0A0A0MS05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV5-7A0A0A0MS05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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