Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms