Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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