Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms