Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF8

HSP90AB2P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB2PQ58FF8 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSP90AB2PQ58FF8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms