Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNIQ14094 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms