Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC14A2-201ENST00000255226 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SIRPB1-204ENST00000381603 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MBP-211ENST00000397875 2168 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GBA-204ENST00000428024 1817 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PDYN-203ENST00000540134 2472 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZNF571-206ENST00000593133 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL139274.2-201ENST00000606274 4127 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL139348.1-201ENST00000569070 2208 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AMIGO2-203ENST00000550413 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL445531.1-201ENST00000562653 1728 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NEFL-204ENST00000639464 3205 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 VIPAS39-211ENST00000557658 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZNF566-209ENST00000493391 3425 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRDM7-202ENST00000449207 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms