Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFFO1Q0D2I5 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms