Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC107892.1-201ENST00000577382 2727 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PDYN-203ENST00000540134 2472 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SEPT10-203ENST00000397714 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TIAM2-206ENST00000456877 3275 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms