Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 NTRK2-204ENST00000359847 6646 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CAPN9-202ENST00000354537 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 RCVRN-201ENST00000226193 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC009264.1-205ENST00000439694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 LINC00877-203ENST00000468646 2506 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 LRRC46-201ENST00000269025 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CNBD2-201ENST00000349339 1927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 TP53-218ENST00000610292 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 MPI-202ENST00000352410 5828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PCAT1-202ENST00000561978 1992 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SMAD9-202ENST00000379826 5592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TMEM258P61165 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TMEM258P61165 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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TMEM258P61165 AL160006.1-201ENST00000554749 4216 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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TMEM258P61165 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TMEM258P61165 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TMEM258P61165 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SIRPB1-202ENST00000279477 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ZNF597-201ENST00000301744 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC008659.1-201ENST00000501834 1458 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMEM258P61165 CCDC87-201ENST00000333861 2908 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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