Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB3P54284 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB3P54284 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms