Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK1EP49674 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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