Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBP1P32455 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBP1P32455 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms