Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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HOXA13P31271 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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HOXA13P31271 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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HOXA13P31271 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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