Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MARCKSP29966 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms