Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DMDP11532 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMDP11532 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMDP11532 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMDP11532 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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