Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms